Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCHIP1Q9P0W5 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms