Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W0

IFNK, Interferon kappa, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNKQ9P0W0 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFNKQ9P0W0 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFNKQ9P0W0 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFNKQ9P0W0 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFNKQ9P0W0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFNKQ9P0W0 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFNKQ9P0W0 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
IFNKQ9P0W0 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFNKQ9P0W0 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFNKQ9P0W0 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFNKQ9P0W0 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFNKQ9P0W0 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFNKQ9P0W0 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFNKQ9P0W0 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFNKQ9P0W0 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFNKQ9P0W0 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFNKQ9P0W0 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFNKQ9P0W0 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFNKQ9P0W0 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFNKQ9P0W0 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFNKQ9P0W0 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFNKQ9P0W0 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
IFNKQ9P0W0 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFNKQ9P0W0 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFNKQ9P0W0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFNKQ9P0W0 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFNKQ9P0W0 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFNKQ9P0W0 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFNKQ9P0W0 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFNKQ9P0W0 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
IFNKQ9P0W0 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
IFNKQ9P0W0 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms