Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZR2

LRP1B, Low-density lipoprotein receptor-related protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 4,599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1BQ9NZR2 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LRP1BQ9NZR2 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
LRP1BQ9NZR2 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LRP1BQ9NZR2 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LRP1BQ9NZR2 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LRP1BQ9NZR2 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LRP1BQ9NZR2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LRP1BQ9NZR2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LRP1BQ9NZR2 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LRP1BQ9NZR2 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LRP1BQ9NZR2 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LRP1BQ9NZR2 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
LRP1BQ9NZR2 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LRP1BQ9NZR2 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
LRP1BQ9NZR2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LRP1BQ9NZR2 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LRP1BQ9NZR2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LRP1BQ9NZR2 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LRP1BQ9NZR2 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LRP1BQ9NZR2 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
LRP1BQ9NZR2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LRP1BQ9NZR2 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LRP1BQ9NZR2 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LRP1BQ9NZR2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LRP1BQ9NZR2 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LRP1BQ9NZR2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LRP1BQ9NZR2 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LRP1BQ9NZR2 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LRP1BQ9NZR2 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LRP1BQ9NZR2 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LRP1BQ9NZR2 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LRP1BQ9NZR2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LRP1BQ9NZR2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LRP1BQ9NZR2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LRP1BQ9NZR2 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
LRP1BQ9NZR2 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LRP1BQ9NZR2 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LRP1BQ9NZR2 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LRP1BQ9NZR2 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
LRP1BQ9NZR2 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LRP1BQ9NZR2 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LRP1BQ9NZR2 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LRP1BQ9NZR2 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
LRP1BQ9NZR2 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
LRP1BQ9NZR2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LRP1BQ9NZR2 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LRP1BQ9NZR2 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LRP1BQ9NZR2 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LRP1BQ9NZR2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LRP1BQ9NZR2 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LRP1BQ9NZR2 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
LRP1BQ9NZR2 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LRP1BQ9NZR2 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
LRP1BQ9NZR2 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LRP1BQ9NZR2 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LRP1BQ9NZR2 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LRP1BQ9NZR2 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
LRP1BQ9NZR2 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
LRP1BQ9NZR2 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
LRP1BQ9NZR2 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LRP1BQ9NZR2 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
LRP1BQ9NZR2 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LRP1BQ9NZR2 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LRP1BQ9NZR2 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LRP1BQ9NZR2 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LRP1BQ9NZR2 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
LRP1BQ9NZR2 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC13□□□□□ -0.33
LRP1BQ9NZR2 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
LRP1BQ9NZR2 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
LRP1BQ9NZR2 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
LRP1BQ9NZR2 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
LRP1BQ9NZR2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LRP1BQ9NZR2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LRP1BQ9NZR2 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LRP1BQ9NZR2 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
LRP1BQ9NZR2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LRP1BQ9NZR2 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LRP1BQ9NZR2 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LRP1BQ9NZR2 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LRP1BQ9NZR2 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LRP1BQ9NZR2 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LRP1BQ9NZR2 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LRP1BQ9NZR2 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LRP1BQ9NZR2 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LRP1BQ9NZR2 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LRP1BQ9NZR2 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LRP1BQ9NZR2 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LRP1BQ9NZR2 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LRP1BQ9NZR2 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LRP1BQ9NZR2 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LRP1BQ9NZR2 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LRP1BQ9NZR2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LRP1BQ9NZR2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LRP1BQ9NZR2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LRP1BQ9NZR2 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LRP1BQ9NZR2 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LRP1BQ9NZR2 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LRP1BQ9NZR2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LRP1BQ9NZR2 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LRP1BQ9NZR2 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms