Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYA4

MTMR4, Myotubularin-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR4Q9NYA4 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MTMR4Q9NYA4 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MTMR4Q9NYA4 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MTMR4Q9NYA4 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MTMR4Q9NYA4 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MTMR4Q9NYA4 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MTMR4Q9NYA4 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MTMR4Q9NYA4 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MTMR4Q9NYA4 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MTMR4Q9NYA4 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MTMR4Q9NYA4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MTMR4Q9NYA4 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTMR4Q9NYA4 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
MTMR4Q9NYA4 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTMR4Q9NYA4 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTMR4Q9NYA4 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTMR4Q9NYA4 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTMR4Q9NYA4 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTMR4Q9NYA4 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTMR4Q9NYA4 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTMR4Q9NYA4 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
MTMR4Q9NYA4 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
MTMR4Q9NYA4 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTMR4Q9NYA4 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
MTMR4Q9NYA4 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTMR4Q9NYA4 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
MTMR4Q9NYA4 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTMR4Q9NYA4 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTMR4Q9NYA4 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTMR4Q9NYA4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTMR4Q9NYA4 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTMR4Q9NYA4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTMR4Q9NYA4 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MTMR4Q9NYA4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MTMR4Q9NYA4 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MTMR4Q9NYA4 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MTMR4Q9NYA4 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MTMR4Q9NYA4 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MTMR4Q9NYA4 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MTMR4Q9NYA4 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MTMR4Q9NYA4 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MTMR4Q9NYA4 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MTMR4Q9NYA4 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MTMR4Q9NYA4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MTMR4Q9NYA4 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MTMR4Q9NYA4 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MTMR4Q9NYA4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MTMR4Q9NYA4 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MTMR4Q9NYA4 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MTMR4Q9NYA4 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MTMR4Q9NYA4 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MTMR4Q9NYA4 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MTMR4Q9NYA4 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
MTMR4Q9NYA4 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
MTMR4Q9NYA4 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MTMR4Q9NYA4 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MTMR4Q9NYA4 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MTMR4Q9NYA4 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MTMR4Q9NYA4 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MTMR4Q9NYA4 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MTMR4Q9NYA4 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MTMR4Q9NYA4 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MTMR4Q9NYA4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MTMR4Q9NYA4 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MTMR4Q9NYA4 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MTMR4Q9NYA4 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MTMR4Q9NYA4 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MTMR4Q9NYA4 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MTMR4Q9NYA4 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MTMR4Q9NYA4 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MTMR4Q9NYA4 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MTMR4Q9NYA4 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MTMR4Q9NYA4 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MTMR4Q9NYA4 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
MTMR4Q9NYA4 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MTMR4Q9NYA4 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MTMR4Q9NYA4 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MTMR4Q9NYA4 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MTMR4Q9NYA4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MTMR4Q9NYA4 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MTMR4Q9NYA4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MTMR4Q9NYA4 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MTMR4Q9NYA4 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MTMR4Q9NYA4 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MTMR4Q9NYA4 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MTMR4Q9NYA4 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MTMR4Q9NYA4 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MTMR4Q9NYA4 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MTMR4Q9NYA4 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MTMR4Q9NYA4 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MTMR4Q9NYA4 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MTMR4Q9NYA4 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MTMR4Q9NYA4 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MTMR4Q9NYA4 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MTMR4Q9NYA4 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MTMR4Q9NYA4 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MTMR4Q9NYA4 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MTMR4Q9NYA4 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MTMR4Q9NYA4 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MTMR4Q9NYA4 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms