Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMBRD1Q9NUN5 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMBRD1Q9NUN5 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMBRD1Q9NUN5 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LMBRD1Q9NUN5 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LMBRD1Q9NUN5 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LMBRD1Q9NUN5 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LMBRD1Q9NUN5 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LMBRD1Q9NUN5 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LMBRD1Q9NUN5 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LMBRD1Q9NUN5 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LMBRD1Q9NUN5 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LMBRD1Q9NUN5 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMBRD1Q9NUN5 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMBRD1Q9NUN5 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMBRD1Q9NUN5 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMBRD1Q9NUN5 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMBRD1Q9NUN5 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMBRD1Q9NUN5 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMBRD1Q9NUN5 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMBRD1Q9NUN5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMBRD1Q9NUN5 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMBRD1Q9NUN5 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMBRD1Q9NUN5 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMBRD1Q9NUN5 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMBRD1Q9NUN5 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMBRD1Q9NUN5 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMBRD1Q9NUN5 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMBRD1Q9NUN5 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMBRD1Q9NUN5 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMBRD1Q9NUN5 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMBRD1Q9NUN5 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMBRD1Q9NUN5 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMBRD1Q9NUN5 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMBRD1Q9NUN5 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMBRD1Q9NUN5 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMBRD1Q9NUN5 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMBRD1Q9NUN5 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMBRD1Q9NUN5 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMBRD1Q9NUN5 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMBRD1Q9NUN5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMBRD1Q9NUN5 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMBRD1Q9NUN5 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMBRD1Q9NUN5 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMBRD1Q9NUN5 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMBRD1Q9NUN5 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMBRD1Q9NUN5 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMBRD1Q9NUN5 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMBRD1Q9NUN5 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LMBRD1Q9NUN5 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMBRD1Q9NUN5 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMBRD1Q9NUN5 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LMBRD1Q9NUN5 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LMBRD1Q9NUN5 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LMBRD1Q9NUN5 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LMBRD1Q9NUN5 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LMBRD1Q9NUN5 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LMBRD1Q9NUN5 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LMBRD1Q9NUN5 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LMBRD1Q9NUN5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
LMBRD1Q9NUN5 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LMBRD1Q9NUN5 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LMBRD1Q9NUN5 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LMBRD1Q9NUN5 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LMBRD1Q9NUN5 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LMBRD1Q9NUN5 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LMBRD1Q9NUN5 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LMBRD1Q9NUN5 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LMBRD1Q9NUN5 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LMBRD1Q9NUN5 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LMBRD1Q9NUN5 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LMBRD1Q9NUN5 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LMBRD1Q9NUN5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LMBRD1Q9NUN5 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LMBRD1Q9NUN5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LMBRD1Q9NUN5 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LMBRD1Q9NUN5 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LMBRD1Q9NUN5 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LMBRD1Q9NUN5 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LMBRD1Q9NUN5 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LMBRD1Q9NUN5 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LMBRD1Q9NUN5 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LMBRD1Q9NUN5 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMBRD1Q9NUN5 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMBRD1Q9NUN5 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMBRD1Q9NUN5 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMBRD1Q9NUN5 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
LMBRD1Q9NUN5 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMBRD1Q9NUN5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
LMBRD1Q9NUN5 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMBRD1Q9NUN5 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMBRD1Q9NUN5 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMBRD1Q9NUN5 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMBRD1Q9NUN5 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMBRD1Q9NUN5 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMBRD1Q9NUN5 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMBRD1Q9NUN5 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMBRD1Q9NUN5 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMBRD1Q9NUN5 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
LMBRD1Q9NUN5 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms