Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD4

ZNF275, Zinc finger protein 275, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF275Q9NSD4 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF275Q9NSD4 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF275Q9NSD4 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF275Q9NSD4 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF275Q9NSD4 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF275Q9NSD4 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF275Q9NSD4 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
ZNF275Q9NSD4 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
ZNF275Q9NSD4 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF275Q9NSD4 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF275Q9NSD4 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF275Q9NSD4 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF275Q9NSD4 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF275Q9NSD4 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF275Q9NSD4 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF275Q9NSD4 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF275Q9NSD4 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF275Q9NSD4 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF275Q9NSD4 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF275Q9NSD4 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF275Q9NSD4 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF275Q9NSD4 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF275Q9NSD4 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF275Q9NSD4 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF275Q9NSD4 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF275Q9NSD4 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF275Q9NSD4 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF275Q9NSD4 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF275Q9NSD4 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF275Q9NSD4 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF275Q9NSD4 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF275Q9NSD4 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF275Q9NSD4 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF275Q9NSD4 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF275Q9NSD4 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF275Q9NSD4 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF275Q9NSD4 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF275Q9NSD4 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF275Q9NSD4 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF275Q9NSD4 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF275Q9NSD4 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF275Q9NSD4 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF275Q9NSD4 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF275Q9NSD4 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF275Q9NSD4 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF275Q9NSD4 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF275Q9NSD4 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF275Q9NSD4 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF275Q9NSD4 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF275Q9NSD4 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF275Q9NSD4 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF275Q9NSD4 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF275Q9NSD4 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF275Q9NSD4 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF275Q9NSD4 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF275Q9NSD4 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF275Q9NSD4 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF275Q9NSD4 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF275Q9NSD4 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF275Q9NSD4 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF275Q9NSD4 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF275Q9NSD4 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF275Q9NSD4 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF275Q9NSD4 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF275Q9NSD4 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF275Q9NSD4 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF275Q9NSD4 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF275Q9NSD4 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF275Q9NSD4 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF275Q9NSD4 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF275Q9NSD4 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF275Q9NSD4 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF275Q9NSD4 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF275Q9NSD4 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF275Q9NSD4 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF275Q9NSD4 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF275Q9NSD4 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF275Q9NSD4 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF275Q9NSD4 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF275Q9NSD4 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF275Q9NSD4 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF275Q9NSD4 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF275Q9NSD4 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF275Q9NSD4 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF275Q9NSD4 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF275Q9NSD4 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF275Q9NSD4 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF275Q9NSD4 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF275Q9NSD4 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF275Q9NSD4 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF275Q9NSD4 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF275Q9NSD4 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF275Q9NSD4 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF275Q9NSD4 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF275Q9NSD4 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF275Q9NSD4 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF275Q9NSD4 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF275Q9NSD4 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF275Q9NSD4 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF275Q9NSD4 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms