Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB4

KRT82, Keratin, type II cuticular Hb2, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT82Q9NSB4 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT82Q9NSB4 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT82Q9NSB4 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT82Q9NSB4 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT82Q9NSB4 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KRT82Q9NSB4 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KRT82Q9NSB4 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KRT82Q9NSB4 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KRT82Q9NSB4 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KRT82Q9NSB4 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
KRT82Q9NSB4 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KRT82Q9NSB4 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KRT82Q9NSB4 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT82Q9NSB4 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT82Q9NSB4 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT82Q9NSB4 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT82Q9NSB4 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT82Q9NSB4 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT82Q9NSB4 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT82Q9NSB4 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT82Q9NSB4 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT82Q9NSB4 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT82Q9NSB4 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT82Q9NSB4 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT82Q9NSB4 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT82Q9NSB4 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT82Q9NSB4 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT82Q9NSB4 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT82Q9NSB4 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT82Q9NSB4 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT82Q9NSB4 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT82Q9NSB4 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT82Q9NSB4 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT82Q9NSB4 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT82Q9NSB4 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT82Q9NSB4 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT82Q9NSB4 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT82Q9NSB4 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT82Q9NSB4 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT82Q9NSB4 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT82Q9NSB4 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT82Q9NSB4 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT82Q9NSB4 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT82Q9NSB4 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT82Q9NSB4 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT82Q9NSB4 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT82Q9NSB4 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT82Q9NSB4 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT82Q9NSB4 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT82Q9NSB4 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT82Q9NSB4 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT82Q9NSB4 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT82Q9NSB4 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT82Q9NSB4 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT82Q9NSB4 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT82Q9NSB4 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT82Q9NSB4 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT82Q9NSB4 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT82Q9NSB4 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT82Q9NSB4 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT82Q9NSB4 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT82Q9NSB4 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT82Q9NSB4 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT82Q9NSB4 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT82Q9NSB4 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT82Q9NSB4 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT82Q9NSB4 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT82Q9NSB4 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT82Q9NSB4 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT82Q9NSB4 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT82Q9NSB4 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT82Q9NSB4 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT82Q9NSB4 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT82Q9NSB4 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT82Q9NSB4 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT82Q9NSB4 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT82Q9NSB4 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT82Q9NSB4 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT82Q9NSB4 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT82Q9NSB4 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT82Q9NSB4 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT82Q9NSB4 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT82Q9NSB4 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRT82Q9NSB4 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRT82Q9NSB4 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRT82Q9NSB4 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRT82Q9NSB4 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRT82Q9NSB4 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRT82Q9NSB4 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRT82Q9NSB4 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRT82Q9NSB4 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRT82Q9NSB4 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRT82Q9NSB4 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRT82Q9NSB4 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRT82Q9NSB4 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRT82Q9NSB4 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRT82Q9NSB4 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRT82Q9NSB4 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRT82Q9NSB4 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRT82Q9NSB4 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms