Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS4

TMPRSS4, Transmembrane protease serine 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4Q9NRS4 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMPRSS4Q9NRS4 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMPRSS4Q9NRS4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMPRSS4Q9NRS4 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMPRSS4Q9NRS4 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMPRSS4Q9NRS4 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMPRSS4Q9NRS4 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMPRSS4Q9NRS4 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMPRSS4Q9NRS4 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMPRSS4Q9NRS4 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMPRSS4Q9NRS4 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMPRSS4Q9NRS4 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMPRSS4Q9NRS4 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMPRSS4Q9NRS4 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMPRSS4Q9NRS4 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMPRSS4Q9NRS4 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMPRSS4Q9NRS4 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TMPRSS4Q9NRS4 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMPRSS4Q9NRS4 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMPRSS4Q9NRS4 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMPRSS4Q9NRS4 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMPRSS4Q9NRS4 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMPRSS4Q9NRS4 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMPRSS4Q9NRS4 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TMPRSS4Q9NRS4 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TMPRSS4Q9NRS4 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TMPRSS4Q9NRS4 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMPRSS4Q9NRS4 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMPRSS4Q9NRS4 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMPRSS4Q9NRS4 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMPRSS4Q9NRS4 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMPRSS4Q9NRS4 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMPRSS4Q9NRS4 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMPRSS4Q9NRS4 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMPRSS4Q9NRS4 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMPRSS4Q9NRS4 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMPRSS4Q9NRS4 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMPRSS4Q9NRS4 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMPRSS4Q9NRS4 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMPRSS4Q9NRS4 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMPRSS4Q9NRS4 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMPRSS4Q9NRS4 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMPRSS4Q9NRS4 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TMPRSS4Q9NRS4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMPRSS4Q9NRS4 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMPRSS4Q9NRS4 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMPRSS4Q9NRS4 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMPRSS4Q9NRS4 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMPRSS4Q9NRS4 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMPRSS4Q9NRS4 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMPRSS4Q9NRS4 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMPRSS4Q9NRS4 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMPRSS4Q9NRS4 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMPRSS4Q9NRS4 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMPRSS4Q9NRS4 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMPRSS4Q9NRS4 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMPRSS4Q9NRS4 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMPRSS4Q9NRS4 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMPRSS4Q9NRS4 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMPRSS4Q9NRS4 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMPRSS4Q9NRS4 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMPRSS4Q9NRS4 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMPRSS4Q9NRS4 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMPRSS4Q9NRS4 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TMPRSS4Q9NRS4 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TMPRSS4Q9NRS4 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TMPRSS4Q9NRS4 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMPRSS4Q9NRS4 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMPRSS4Q9NRS4 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMPRSS4Q9NRS4 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TMPRSS4Q9NRS4 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMPRSS4Q9NRS4 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMPRSS4Q9NRS4 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMPRSS4Q9NRS4 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMPRSS4Q9NRS4 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMPRSS4Q9NRS4 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMPRSS4Q9NRS4 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMPRSS4Q9NRS4 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMPRSS4Q9NRS4 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMPRSS4Q9NRS4 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMPRSS4Q9NRS4 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMPRSS4Q9NRS4 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMPRSS4Q9NRS4 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMPRSS4Q9NRS4 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMPRSS4Q9NRS4 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMPRSS4Q9NRS4 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMPRSS4Q9NRS4 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMPRSS4Q9NRS4 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMPRSS4Q9NRS4 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMPRSS4Q9NRS4 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMPRSS4Q9NRS4 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMPRSS4Q9NRS4 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TMPRSS4Q9NRS4 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMPRSS4Q9NRS4 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMPRSS4Q9NRS4 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMPRSS4Q9NRS4 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMPRSS4Q9NRS4 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMPRSS4Q9NRS4 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms