Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD9

DUOX1, Dual oxidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX1Q9NRD9 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DUOX1Q9NRD9 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DUOX1Q9NRD9 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DUOX1Q9NRD9 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DUOX1Q9NRD9 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DUOX1Q9NRD9 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DUOX1Q9NRD9 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DUOX1Q9NRD9 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DUOX1Q9NRD9 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DUOX1Q9NRD9 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DUOX1Q9NRD9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DUOX1Q9NRD9 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DUOX1Q9NRD9 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DUOX1Q9NRD9 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DUOX1Q9NRD9 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DUOX1Q9NRD9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DUOX1Q9NRD9 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DUOX1Q9NRD9 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DUOX1Q9NRD9 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
DUOX1Q9NRD9 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DUOX1Q9NRD9 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DUOX1Q9NRD9 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DUOX1Q9NRD9 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DUOX1Q9NRD9 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DUOX1Q9NRD9 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DUOX1Q9NRD9 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DUOX1Q9NRD9 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DUOX1Q9NRD9 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DUOX1Q9NRD9 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DUOX1Q9NRD9 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DUOX1Q9NRD9 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DUOX1Q9NRD9 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DUOX1Q9NRD9 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DUOX1Q9NRD9 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DUOX1Q9NRD9 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DUOX1Q9NRD9 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
DUOX1Q9NRD9 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DUOX1Q9NRD9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DUOX1Q9NRD9 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DUOX1Q9NRD9 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DUOX1Q9NRD9 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DUOX1Q9NRD9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DUOX1Q9NRD9 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DUOX1Q9NRD9 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DUOX1Q9NRD9 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DUOX1Q9NRD9 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
DUOX1Q9NRD9 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
DUOX1Q9NRD9 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DUOX1Q9NRD9 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DUOX1Q9NRD9 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DUOX1Q9NRD9 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DUOX1Q9NRD9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
DUOX1Q9NRD9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
DUOX1Q9NRD9 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
DUOX1Q9NRD9 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
DUOX1Q9NRD9 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
DUOX1Q9NRD9 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
DUOX1Q9NRD9 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
DUOX1Q9NRD9 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DUOX1Q9NRD9 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DUOX1Q9NRD9 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DUOX1Q9NRD9 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DUOX1Q9NRD9 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DUOX1Q9NRD9 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DUOX1Q9NRD9 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DUOX1Q9NRD9 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DUOX1Q9NRD9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DUOX1Q9NRD9 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DUOX1Q9NRD9 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DUOX1Q9NRD9 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DUOX1Q9NRD9 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DUOX1Q9NRD9 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DUOX1Q9NRD9 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DUOX1Q9NRD9 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DUOX1Q9NRD9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DUOX1Q9NRD9 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
DUOX1Q9NRD9 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DUOX1Q9NRD9 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DUOX1Q9NRD9 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DUOX1Q9NRD9 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DUOX1Q9NRD9 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DUOX1Q9NRD9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DUOX1Q9NRD9 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DUOX1Q9NRD9 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DUOX1Q9NRD9 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DUOX1Q9NRD9 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DUOX1Q9NRD9 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DUOX1Q9NRD9 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DUOX1Q9NRD9 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DUOX1Q9NRD9 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DUOX1Q9NRD9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DUOX1Q9NRD9 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DUOX1Q9NRD9 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DUOX1Q9NRD9 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DUOX1Q9NRD9 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DUOX1Q9NRD9 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DUOX1Q9NRD9 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DUOX1Q9NRD9 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
DUOX1Q9NRD9 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DUOX1Q9NRD9 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms