Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPP4

NLRC4, NLR family CARD domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC4Q9NPP4 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NLRC4Q9NPP4 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NLRC4Q9NPP4 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NLRC4Q9NPP4 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NLRC4Q9NPP4 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NLRC4Q9NPP4 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NLRC4Q9NPP4 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NLRC4Q9NPP4 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NLRC4Q9NPP4 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NLRC4Q9NPP4 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NLRC4Q9NPP4 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NLRC4Q9NPP4 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NLRC4Q9NPP4 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NLRC4Q9NPP4 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NLRC4Q9NPP4 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NLRC4Q9NPP4 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NLRC4Q9NPP4 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NLRC4Q9NPP4 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NLRC4Q9NPP4 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NLRC4Q9NPP4 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NLRC4Q9NPP4 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NLRC4Q9NPP4 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NLRC4Q9NPP4 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NLRC4Q9NPP4 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NLRC4Q9NPP4 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NLRC4Q9NPP4 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NLRC4Q9NPP4 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NLRC4Q9NPP4 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NLRC4Q9NPP4 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NLRC4Q9NPP4 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NLRC4Q9NPP4 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NLRC4Q9NPP4 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NLRC4Q9NPP4 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NLRC4Q9NPP4 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NLRC4Q9NPP4 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NLRC4Q9NPP4 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NLRC4Q9NPP4 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NLRC4Q9NPP4 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NLRC4Q9NPP4 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NLRC4Q9NPP4 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NLRC4Q9NPP4 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NLRC4Q9NPP4 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NLRC4Q9NPP4 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NLRC4Q9NPP4 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NLRC4Q9NPP4 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NLRC4Q9NPP4 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NLRC4Q9NPP4 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NLRC4Q9NPP4 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NLRC4Q9NPP4 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NLRC4Q9NPP4 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NLRC4Q9NPP4 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NLRC4Q9NPP4 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NLRC4Q9NPP4 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NLRC4Q9NPP4 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NLRC4Q9NPP4 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NLRC4Q9NPP4 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NLRC4Q9NPP4 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NLRC4Q9NPP4 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NLRC4Q9NPP4 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NLRC4Q9NPP4 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NLRC4Q9NPP4 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NLRC4Q9NPP4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NLRC4Q9NPP4 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NLRC4Q9NPP4 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NLRC4Q9NPP4 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NLRC4Q9NPP4 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NLRC4Q9NPP4 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NLRC4Q9NPP4 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NLRC4Q9NPP4 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NLRC4Q9NPP4 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NLRC4Q9NPP4 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NLRC4Q9NPP4 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
NLRC4Q9NPP4 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NLRC4Q9NPP4 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NLRC4Q9NPP4 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NLRC4Q9NPP4 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NLRC4Q9NPP4 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NLRC4Q9NPP4 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NLRC4Q9NPP4 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NLRC4Q9NPP4 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NLRC4Q9NPP4 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NLRC4Q9NPP4 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NLRC4Q9NPP4 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NLRC4Q9NPP4 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NLRC4Q9NPP4 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NLRC4Q9NPP4 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NLRC4Q9NPP4 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NLRC4Q9NPP4 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NLRC4Q9NPP4 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NLRC4Q9NPP4 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NLRC4Q9NPP4 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NLRC4Q9NPP4 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NLRC4Q9NPP4 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NLRC4Q9NPP4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NLRC4Q9NPP4 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NLRC4Q9NPP4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NLRC4Q9NPP4 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NLRC4Q9NPP4 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NLRC4Q9NPP4 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NLRC4Q9NPP4 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms