Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP80

PNPLA8, Calcium-independent phospholipase A2-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA8Q9NP80 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PNPLA8Q9NP80 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PNPLA8Q9NP80 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PNPLA8Q9NP80 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PNPLA8Q9NP80 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PNPLA8Q9NP80 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PNPLA8Q9NP80 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PNPLA8Q9NP80 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PNPLA8Q9NP80 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PNPLA8Q9NP80 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PNPLA8Q9NP80 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PNPLA8Q9NP80 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PNPLA8Q9NP80 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PNPLA8Q9NP80 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PNPLA8Q9NP80 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PNPLA8Q9NP80 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PNPLA8Q9NP80 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PNPLA8Q9NP80 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PNPLA8Q9NP80 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PNPLA8Q9NP80 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PNPLA8Q9NP80 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PNPLA8Q9NP80 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PNPLA8Q9NP80 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PNPLA8Q9NP80 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PNPLA8Q9NP80 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PNPLA8Q9NP80 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PNPLA8Q9NP80 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PNPLA8Q9NP80 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PNPLA8Q9NP80 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PNPLA8Q9NP80 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PNPLA8Q9NP80 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PNPLA8Q9NP80 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PNPLA8Q9NP80 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PNPLA8Q9NP80 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PNPLA8Q9NP80 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PNPLA8Q9NP80 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PNPLA8Q9NP80 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PNPLA8Q9NP80 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PNPLA8Q9NP80 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PNPLA8Q9NP80 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PNPLA8Q9NP80 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PNPLA8Q9NP80 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PNPLA8Q9NP80 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PNPLA8Q9NP80 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PNPLA8Q9NP80 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PNPLA8Q9NP80 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PNPLA8Q9NP80 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PNPLA8Q9NP80 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PNPLA8Q9NP80 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PNPLA8Q9NP80 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PNPLA8Q9NP80 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PNPLA8Q9NP80 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PNPLA8Q9NP80 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PNPLA8Q9NP80 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PNPLA8Q9NP80 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PNPLA8Q9NP80 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PNPLA8Q9NP80 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PNPLA8Q9NP80 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PNPLA8Q9NP80 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PNPLA8Q9NP80 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PNPLA8Q9NP80 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PNPLA8Q9NP80 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PNPLA8Q9NP80 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PNPLA8Q9NP80 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PNPLA8Q9NP80 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PNPLA8Q9NP80 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PNPLA8Q9NP80 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PNPLA8Q9NP80 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PNPLA8Q9NP80 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PNPLA8Q9NP80 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PNPLA8Q9NP80 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PNPLA8Q9NP80 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PNPLA8Q9NP80 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PNPLA8Q9NP80 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PNPLA8Q9NP80 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PNPLA8Q9NP80 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PNPLA8Q9NP80 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PNPLA8Q9NP80 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PNPLA8Q9NP80 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PNPLA8Q9NP80 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PNPLA8Q9NP80 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PNPLA8Q9NP80 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PNPLA8Q9NP80 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PNPLA8Q9NP80 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PNPLA8Q9NP80 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PNPLA8Q9NP80 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PNPLA8Q9NP80 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PNPLA8Q9NP80 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PNPLA8Q9NP80 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PNPLA8Q9NP80 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PNPLA8Q9NP80 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PNPLA8Q9NP80 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PNPLA8Q9NP80 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PNPLA8Q9NP80 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PNPLA8Q9NP80 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PNPLA8Q9NP80 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PNPLA8Q9NP80 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PNPLA8Q9NP80 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PNPLA8Q9NP80 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PNPLA8Q9NP80 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms