Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP78

ABCB9, ATP-binding cassette sub-family B member 9, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB9Q9NP78 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
ABCB9Q9NP78 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ABCB9Q9NP78 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ABCB9Q9NP78 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABCB9Q9NP78 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABCB9Q9NP78 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABCB9Q9NP78 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABCB9Q9NP78 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABCB9Q9NP78 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABCB9Q9NP78 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABCB9Q9NP78 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABCB9Q9NP78 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABCB9Q9NP78 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ABCB9Q9NP78 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABCB9Q9NP78 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABCB9Q9NP78 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABCB9Q9NP78 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABCB9Q9NP78 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABCB9Q9NP78 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABCB9Q9NP78 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABCB9Q9NP78 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABCB9Q9NP78 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABCB9Q9NP78 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms