Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2E6

SEMA6A, Semaphorin-6A, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6AQ9H2E6 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEMA6AQ9H2E6 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEMA6AQ9H2E6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEMA6AQ9H2E6 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEMA6AQ9H2E6 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEMA6AQ9H2E6 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEMA6AQ9H2E6 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEMA6AQ9H2E6 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEMA6AQ9H2E6 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEMA6AQ9H2E6 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEMA6AQ9H2E6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEMA6AQ9H2E6 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEMA6AQ9H2E6 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEMA6AQ9H2E6 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEMA6AQ9H2E6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEMA6AQ9H2E6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEMA6AQ9H2E6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEMA6AQ9H2E6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEMA6AQ9H2E6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEMA6AQ9H2E6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEMA6AQ9H2E6 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEMA6AQ9H2E6 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEMA6AQ9H2E6 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEMA6AQ9H2E6 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEMA6AQ9H2E6 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEMA6AQ9H2E6 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEMA6AQ9H2E6 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEMA6AQ9H2E6 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEMA6AQ9H2E6 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEMA6AQ9H2E6 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEMA6AQ9H2E6 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEMA6AQ9H2E6 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEMA6AQ9H2E6 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEMA6AQ9H2E6 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEMA6AQ9H2E6 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEMA6AQ9H2E6 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEMA6AQ9H2E6 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEMA6AQ9H2E6 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEMA6AQ9H2E6 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEMA6AQ9H2E6 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEMA6AQ9H2E6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEMA6AQ9H2E6 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SEMA6AQ9H2E6 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEMA6AQ9H2E6 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEMA6AQ9H2E6 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEMA6AQ9H2E6 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEMA6AQ9H2E6 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEMA6AQ9H2E6 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEMA6AQ9H2E6 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEMA6AQ9H2E6 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEMA6AQ9H2E6 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA6AQ9H2E6 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA6AQ9H2E6 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA6AQ9H2E6 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA6AQ9H2E6 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA6AQ9H2E6 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA6AQ9H2E6 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA6AQ9H2E6 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA6AQ9H2E6 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA6AQ9H2E6 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA6AQ9H2E6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA6AQ9H2E6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA6AQ9H2E6 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA6AQ9H2E6 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA6AQ9H2E6 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA6AQ9H2E6 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA6AQ9H2E6 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA6AQ9H2E6 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA6AQ9H2E6 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA6AQ9H2E6 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA6AQ9H2E6 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA6AQ9H2E6 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SEMA6AQ9H2E6 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SEMA6AQ9H2E6 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SEMA6AQ9H2E6 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SEMA6AQ9H2E6 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SEMA6AQ9H2E6 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SEMA6AQ9H2E6 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SEMA6AQ9H2E6 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SEMA6AQ9H2E6 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEMA6AQ9H2E6 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEMA6AQ9H2E6 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEMA6AQ9H2E6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEMA6AQ9H2E6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEMA6AQ9H2E6 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEMA6AQ9H2E6 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEMA6AQ9H2E6 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEMA6AQ9H2E6 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEMA6AQ9H2E6 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEMA6AQ9H2E6 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEMA6AQ9H2E6 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEMA6AQ9H2E6 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEMA6AQ9H2E6 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEMA6AQ9H2E6 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEMA6AQ9H2E6 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEMA6AQ9H2E6 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEMA6AQ9H2E6 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEMA6AQ9H2E6 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEMA6AQ9H2E6 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEMA6AQ9H2E6 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms