Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0Q0

FAM49A, Protein FAM49A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM49AQ9H0Q0 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM49AQ9H0Q0 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM49AQ9H0Q0 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM49AQ9H0Q0 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM49AQ9H0Q0 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM49AQ9H0Q0 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM49AQ9H0Q0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM49AQ9H0Q0 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM49AQ9H0Q0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM49AQ9H0Q0 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM49AQ9H0Q0 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM49AQ9H0Q0 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM49AQ9H0Q0 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM49AQ9H0Q0 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM49AQ9H0Q0 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM49AQ9H0Q0 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM49AQ9H0Q0 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM49AQ9H0Q0 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM49AQ9H0Q0 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM49AQ9H0Q0 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM49AQ9H0Q0 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM49AQ9H0Q0 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM49AQ9H0Q0 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM49AQ9H0Q0 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM49AQ9H0Q0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM49AQ9H0Q0 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM49AQ9H0Q0 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM49AQ9H0Q0 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM49AQ9H0Q0 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM49AQ9H0Q0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM49AQ9H0Q0 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM49AQ9H0Q0 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM49AQ9H0Q0 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM49AQ9H0Q0 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM49AQ9H0Q0 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM49AQ9H0Q0 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM49AQ9H0Q0 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM49AQ9H0Q0 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM49AQ9H0Q0 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM49AQ9H0Q0 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM49AQ9H0Q0 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM49AQ9H0Q0 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM49AQ9H0Q0 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM49AQ9H0Q0 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM49AQ9H0Q0 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM49AQ9H0Q0 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM49AQ9H0Q0 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM49AQ9H0Q0 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM49AQ9H0Q0 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM49AQ9H0Q0 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM49AQ9H0Q0 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM49AQ9H0Q0 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM49AQ9H0Q0 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM49AQ9H0Q0 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM49AQ9H0Q0 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FAM49AQ9H0Q0 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FAM49AQ9H0Q0 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FAM49AQ9H0Q0 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FAM49AQ9H0Q0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FAM49AQ9H0Q0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FAM49AQ9H0Q0 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FAM49AQ9H0Q0 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FAM49AQ9H0Q0 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM49AQ9H0Q0 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM49AQ9H0Q0 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM49AQ9H0Q0 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM49AQ9H0Q0 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM49AQ9H0Q0 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM49AQ9H0Q0 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM49AQ9H0Q0 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM49AQ9H0Q0 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM49AQ9H0Q0 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM49AQ9H0Q0 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM49AQ9H0Q0 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM49AQ9H0Q0 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM49AQ9H0Q0 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM49AQ9H0Q0 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM49AQ9H0Q0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM49AQ9H0Q0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM49AQ9H0Q0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM49AQ9H0Q0 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM49AQ9H0Q0 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM49AQ9H0Q0 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM49AQ9H0Q0 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM49AQ9H0Q0 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM49AQ9H0Q0 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM49AQ9H0Q0 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM49AQ9H0Q0 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM49AQ9H0Q0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM49AQ9H0Q0 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM49AQ9H0Q0 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM49AQ9H0Q0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM49AQ9H0Q0 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM49AQ9H0Q0 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM49AQ9H0Q0 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM49AQ9H0Q0 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM49AQ9H0Q0 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM49AQ9H0Q0 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM49AQ9H0Q0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM49AQ9H0Q0 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms