Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D3

ZYG11B, Protein zyg-11 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZYG11BQ9C0D3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZYG11BQ9C0D3 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZYG11BQ9C0D3 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZYG11BQ9C0D3 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZYG11BQ9C0D3 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZYG11BQ9C0D3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZYG11BQ9C0D3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZYG11BQ9C0D3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZYG11BQ9C0D3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZYG11BQ9C0D3 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZYG11BQ9C0D3 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZYG11BQ9C0D3 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ZYG11BQ9C0D3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZYG11BQ9C0D3 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZYG11BQ9C0D3 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZYG11BQ9C0D3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZYG11BQ9C0D3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZYG11BQ9C0D3 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZYG11BQ9C0D3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZYG11BQ9C0D3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZYG11BQ9C0D3 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZYG11BQ9C0D3 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZYG11BQ9C0D3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZYG11BQ9C0D3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZYG11BQ9C0D3 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZYG11BQ9C0D3 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZYG11BQ9C0D3 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZYG11BQ9C0D3 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZYG11BQ9C0D3 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZYG11BQ9C0D3 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZYG11BQ9C0D3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZYG11BQ9C0D3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZYG11BQ9C0D3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZYG11BQ9C0D3 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZYG11BQ9C0D3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZYG11BQ9C0D3 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ZYG11BQ9C0D3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZYG11BQ9C0D3 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZYG11BQ9C0D3 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZYG11BQ9C0D3 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZYG11BQ9C0D3 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZYG11BQ9C0D3 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZYG11BQ9C0D3 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZYG11BQ9C0D3 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZYG11BQ9C0D3 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZYG11BQ9C0D3 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZYG11BQ9C0D3 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZYG11BQ9C0D3 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZYG11BQ9C0D3 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ZYG11BQ9C0D3 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZYG11BQ9C0D3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZYG11BQ9C0D3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZYG11BQ9C0D3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZYG11BQ9C0D3 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZYG11BQ9C0D3 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZYG11BQ9C0D3 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZYG11BQ9C0D3 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZYG11BQ9C0D3 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZYG11BQ9C0D3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZYG11BQ9C0D3 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZYG11BQ9C0D3 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZYG11BQ9C0D3 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZYG11BQ9C0D3 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZYG11BQ9C0D3 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZYG11BQ9C0D3 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZYG11BQ9C0D3 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZYG11BQ9C0D3 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZYG11BQ9C0D3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZYG11BQ9C0D3 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZYG11BQ9C0D3 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZYG11BQ9C0D3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZYG11BQ9C0D3 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZYG11BQ9C0D3 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZYG11BQ9C0D3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZYG11BQ9C0D3 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZYG11BQ9C0D3 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZYG11BQ9C0D3 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZYG11BQ9C0D3 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZYG11BQ9C0D3 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZYG11BQ9C0D3 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZYG11BQ9C0D3 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZYG11BQ9C0D3 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZYG11BQ9C0D3 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZYG11BQ9C0D3 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZYG11BQ9C0D3 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZYG11BQ9C0D3 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZYG11BQ9C0D3 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZYG11BQ9C0D3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZYG11BQ9C0D3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ZYG11BQ9C0D3 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ZYG11BQ9C0D3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ZYG11BQ9C0D3 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ZYG11BQ9C0D3 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZYG11BQ9C0D3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZYG11BQ9C0D3 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZYG11BQ9C0D3 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZYG11BQ9C0D3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZYG11BQ9C0D3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZYG11BQ9C0D3 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZYG11BQ9C0D3 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms