Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CIPCQ9C0C6 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CIPCQ9C0C6 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CIPCQ9C0C6 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CIPCQ9C0C6 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CIPCQ9C0C6 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CIPCQ9C0C6 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CIPCQ9C0C6 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CIPCQ9C0C6 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CIPCQ9C0C6 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CIPCQ9C0C6 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CIPCQ9C0C6 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CIPCQ9C0C6 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CIPCQ9C0C6 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CIPCQ9C0C6 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CIPCQ9C0C6 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CIPCQ9C0C6 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CIPCQ9C0C6 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CIPCQ9C0C6 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CIPCQ9C0C6 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CIPCQ9C0C6 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CIPCQ9C0C6 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CIPCQ9C0C6 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CIPCQ9C0C6 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CIPCQ9C0C6 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CIPCQ9C0C6 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CIPCQ9C0C6 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CIPCQ9C0C6 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CIPCQ9C0C6 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CIPCQ9C0C6 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CIPCQ9C0C6 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CIPCQ9C0C6 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CIPCQ9C0C6 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CIPCQ9C0C6 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CIPCQ9C0C6 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CIPCQ9C0C6 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CIPCQ9C0C6 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CIPCQ9C0C6 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CIPCQ9C0C6 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CIPCQ9C0C6 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CIPCQ9C0C6 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CIPCQ9C0C6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CIPCQ9C0C6 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CIPCQ9C0C6 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CIPCQ9C0C6 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CIPCQ9C0C6 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CIPCQ9C0C6 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CIPCQ9C0C6 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CIPCQ9C0C6 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CIPCQ9C0C6 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CIPCQ9C0C6 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CIPCQ9C0C6 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CIPCQ9C0C6 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CIPCQ9C0C6 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CIPCQ9C0C6 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CIPCQ9C0C6 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CIPCQ9C0C6 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CIPCQ9C0C6 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CIPCQ9C0C6 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CIPCQ9C0C6 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CIPCQ9C0C6 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CIPCQ9C0C6 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CIPCQ9C0C6 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CIPCQ9C0C6 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CIPCQ9C0C6 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CIPCQ9C0C6 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CIPCQ9C0C6 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CIPCQ9C0C6 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CIPCQ9C0C6 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CIPCQ9C0C6 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CIPCQ9C0C6 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CIPCQ9C0C6 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CIPCQ9C0C6 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CIPCQ9C0C6 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CIPCQ9C0C6 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CIPCQ9C0C6 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CIPCQ9C0C6 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CIPCQ9C0C6 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CIPCQ9C0C6 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CIPCQ9C0C6 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CIPCQ9C0C6 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CIPCQ9C0C6 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CIPCQ9C0C6 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CIPCQ9C0C6 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CIPCQ9C0C6 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CIPCQ9C0C6 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CIPCQ9C0C6 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CIPCQ9C0C6 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CIPCQ9C0C6 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CIPCQ9C0C6 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CIPCQ9C0C6 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CIPCQ9C0C6 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CIPCQ9C0C6 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CIPCQ9C0C6 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CIPCQ9C0C6 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CIPCQ9C0C6 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CIPCQ9C0C6 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CIPCQ9C0C6 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CIPCQ9C0C6 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CIPCQ9C0C6 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
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