Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NLRP1Q9C000 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NLRP1Q9C000 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NLRP1Q9C000 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NLRP1Q9C000 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NLRP1Q9C000 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NLRP1Q9C000 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NLRP1Q9C000 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NLRP1Q9C000 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NLRP1Q9C000 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NLRP1Q9C000 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NLRP1Q9C000 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NLRP1Q9C000 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NLRP1Q9C000 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NLRP1Q9C000 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NLRP1Q9C000 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NLRP1Q9C000 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NLRP1Q9C000 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NLRP1Q9C000 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NLRP1Q9C000 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NLRP1Q9C000 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NLRP1Q9C000 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NLRP1Q9C000 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NLRP1Q9C000 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NLRP1Q9C000 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NLRP1Q9C000 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NLRP1Q9C000 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
NLRP1Q9C000 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NLRP1Q9C000 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NLRP1Q9C000 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
NLRP1Q9C000 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NLRP1Q9C000 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NLRP1Q9C000 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NLRP1Q9C000 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NLRP1Q9C000 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NLRP1Q9C000 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NLRP1Q9C000 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NLRP1Q9C000 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NLRP1Q9C000 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NLRP1Q9C000 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NLRP1Q9C000 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NLRP1Q9C000 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NLRP1Q9C000 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NLRP1Q9C000 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
NLRP1Q9C000 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NLRP1Q9C000 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NLRP1Q9C000 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NLRP1Q9C000 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NLRP1Q9C000 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NLRP1Q9C000 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
NLRP1Q9C000 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NLRP1Q9C000 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NLRP1Q9C000 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NLRP1Q9C000 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NLRP1Q9C000 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NLRP1Q9C000 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NLRP1Q9C000 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NLRP1Q9C000 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
NLRP1Q9C000 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NLRP1Q9C000 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NLRP1Q9C000 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NLRP1Q9C000 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NLRP1Q9C000 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
NLRP1Q9C000 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NLRP1Q9C000 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NLRP1Q9C000 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NLRP1Q9C000 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NLRP1Q9C000 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NLRP1Q9C000 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NLRP1Q9C000 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NLRP1Q9C000 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NLRP1Q9C000 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NLRP1Q9C000 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NLRP1Q9C000 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
NLRP1Q9C000 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NLRP1Q9C000 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NLRP1Q9C000 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NLRP1Q9C000 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
NLRP1Q9C000 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NLRP1Q9C000 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NLRP1Q9C000 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NLRP1Q9C000 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NLRP1Q9C000 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
NLRP1Q9C000 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NLRP1Q9C000 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NLRP1Q9C000 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NLRP1Q9C000 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NLRP1Q9C000 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NLRP1Q9C000 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NLRP1Q9C000 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NLRP1Q9C000 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NLRP1Q9C000 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NLRP1Q9C000 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NLRP1Q9C000 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NLRP1Q9C000 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
NLRP1Q9C000 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
NLRP1Q9C000 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NLRP1Q9C000 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NLRP1Q9C000 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NLRP1Q9C000 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms