Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZI7

UPF3B, Regulator of nonsense transcripts 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF3BQ9BZI7 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UPF3BQ9BZI7 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UPF3BQ9BZI7 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UPF3BQ9BZI7 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UPF3BQ9BZI7 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UPF3BQ9BZI7 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UPF3BQ9BZI7 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
UPF3BQ9BZI7 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
UPF3BQ9BZI7 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
UPF3BQ9BZI7 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
UPF3BQ9BZI7 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UPF3BQ9BZI7 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UPF3BQ9BZI7 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UPF3BQ9BZI7 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UPF3BQ9BZI7 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UPF3BQ9BZI7 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UPF3BQ9BZI7 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UPF3BQ9BZI7 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UPF3BQ9BZI7 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UPF3BQ9BZI7 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UPF3BQ9BZI7 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UPF3BQ9BZI7 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UPF3BQ9BZI7 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UPF3BQ9BZI7 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UPF3BQ9BZI7 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UPF3BQ9BZI7 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UPF3BQ9BZI7 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UPF3BQ9BZI7 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UPF3BQ9BZI7 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UPF3BQ9BZI7 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UPF3BQ9BZI7 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UPF3BQ9BZI7 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UPF3BQ9BZI7 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UPF3BQ9BZI7 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UPF3BQ9BZI7 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UPF3BQ9BZI7 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UPF3BQ9BZI7 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UPF3BQ9BZI7 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UPF3BQ9BZI7 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UPF3BQ9BZI7 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UPF3BQ9BZI7 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UPF3BQ9BZI7 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UPF3BQ9BZI7 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UPF3BQ9BZI7 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
UPF3BQ9BZI7 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UPF3BQ9BZI7 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UPF3BQ9BZI7 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
UPF3BQ9BZI7 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UPF3BQ9BZI7 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UPF3BQ9BZI7 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UPF3BQ9BZI7 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UPF3BQ9BZI7 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UPF3BQ9BZI7 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UPF3BQ9BZI7 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UPF3BQ9BZI7 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UPF3BQ9BZI7 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UPF3BQ9BZI7 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UPF3BQ9BZI7 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UPF3BQ9BZI7 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UPF3BQ9BZI7 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UPF3BQ9BZI7 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UPF3BQ9BZI7 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UPF3BQ9BZI7 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UPF3BQ9BZI7 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UPF3BQ9BZI7 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UPF3BQ9BZI7 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UPF3BQ9BZI7 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UPF3BQ9BZI7 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UPF3BQ9BZI7 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UPF3BQ9BZI7 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UPF3BQ9BZI7 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UPF3BQ9BZI7 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UPF3BQ9BZI7 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UPF3BQ9BZI7 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UPF3BQ9BZI7 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UPF3BQ9BZI7 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UPF3BQ9BZI7 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UPF3BQ9BZI7 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UPF3BQ9BZI7 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UPF3BQ9BZI7 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UPF3BQ9BZI7 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UPF3BQ9BZI7 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
UPF3BQ9BZI7 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UPF3BQ9BZI7 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UPF3BQ9BZI7 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UPF3BQ9BZI7 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UPF3BQ9BZI7 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UPF3BQ9BZI7 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UPF3BQ9BZI7 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UPF3BQ9BZI7 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UPF3BQ9BZI7 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UPF3BQ9BZI7 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UPF3BQ9BZI7 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UPF3BQ9BZI7 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
UPF3BQ9BZI7 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UPF3BQ9BZI7 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
UPF3BQ9BZI7 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UPF3BQ9BZI7 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UPF3BQ9BZI7 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UPF3BQ9BZI7 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms