Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABARAPL3Q9BY60 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABARAPL3Q9BY60 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GABARAPL3Q9BY60 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABARAPL3Q9BY60 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABARAPL3Q9BY60 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABARAPL3Q9BY60 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABARAPL3Q9BY60 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABARAPL3Q9BY60 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABARAPL3Q9BY60 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABARAPL3Q9BY60 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABARAPL3Q9BY60 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABARAPL3Q9BY60 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABARAPL3Q9BY60 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABARAPL3Q9BY60 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABARAPL3Q9BY60 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABARAPL3Q9BY60 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABARAPL3Q9BY60 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABARAPL3Q9BY60 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABARAPL3Q9BY60 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABARAPL3Q9BY60 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABARAPL3Q9BY60 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GABARAPL3Q9BY60 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABARAPL3Q9BY60 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABARAPL3Q9BY60 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABARAPL3Q9BY60 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms