Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUP58Q9BVL2 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUP58Q9BVL2 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUP58Q9BVL2 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUP58Q9BVL2 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUP58Q9BVL2 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUP58Q9BVL2 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUP58Q9BVL2 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUP58Q9BVL2 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUP58Q9BVL2 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUP58Q9BVL2 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUP58Q9BVL2 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUP58Q9BVL2 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUP58Q9BVL2 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUP58Q9BVL2 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUP58Q9BVL2 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUP58Q9BVL2 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUP58Q9BVL2 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUP58Q9BVL2 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUP58Q9BVL2 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUP58Q9BVL2 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUP58Q9BVL2 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUP58Q9BVL2 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUP58Q9BVL2 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUP58Q9BVL2 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NUP58Q9BVL2 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUP58Q9BVL2 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUP58Q9BVL2 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUP58Q9BVL2 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUP58Q9BVL2 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUP58Q9BVL2 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUP58Q9BVL2 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUP58Q9BVL2 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUP58Q9BVL2 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUP58Q9BVL2 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUP58Q9BVL2 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUP58Q9BVL2 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUP58Q9BVL2 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUP58Q9BVL2 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUP58Q9BVL2 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NUP58Q9BVL2 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUP58Q9BVL2 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUP58Q9BVL2 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUP58Q9BVL2 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NUP58Q9BVL2 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUP58Q9BVL2 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUP58Q9BVL2 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUP58Q9BVL2 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUP58Q9BVL2 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUP58Q9BVL2 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP58Q9BVL2 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP58Q9BVL2 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP58Q9BVL2 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP58Q9BVL2 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP58Q9BVL2 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP58Q9BVL2 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP58Q9BVL2 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP58Q9BVL2 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP58Q9BVL2 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP58Q9BVL2 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP58Q9BVL2 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP58Q9BVL2 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP58Q9BVL2 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP58Q9BVL2 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP58Q9BVL2 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP58Q9BVL2 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP58Q9BVL2 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP58Q9BVL2 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP58Q9BVL2 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUP58Q9BVL2 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUP58Q9BVL2 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUP58Q9BVL2 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUP58Q9BVL2 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUP58Q9BVL2 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUP58Q9BVL2 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUP58Q9BVL2 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUP58Q9BVL2 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUP58Q9BVL2 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUP58Q9BVL2 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUP58Q9BVL2 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUP58Q9BVL2 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUP58Q9BVL2 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUP58Q9BVL2 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUP58Q9BVL2 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUP58Q9BVL2 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NUP58Q9BVL2 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUP58Q9BVL2 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUP58Q9BVL2 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUP58Q9BVL2 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUP58Q9BVL2 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUP58Q9BVL2 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NUP58Q9BVL2 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUP58Q9BVL2 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUP58Q9BVL2 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUP58Q9BVL2 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUP58Q9BVL2 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUP58Q9BVL2 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUP58Q9BVL2 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUP58Q9BVL2 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUP58Q9BVL2 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms