Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG4

PBDC1, Protein PBDC1, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBDC1Q9BVG4 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms