Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT88

SYT11, Synaptotagmin-11, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT11Q9BT88 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYT11Q9BT88 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYT11Q9BT88 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SYT11Q9BT88 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SYT11Q9BT88 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SYT11Q9BT88 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYT11Q9BT88 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYT11Q9BT88 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYT11Q9BT88 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYT11Q9BT88 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYT11Q9BT88 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYT11Q9BT88 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYT11Q9BT88 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYT11Q9BT88 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYT11Q9BT88 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYT11Q9BT88 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYT11Q9BT88 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYT11Q9BT88 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYT11Q9BT88 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYT11Q9BT88 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYT11Q9BT88 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYT11Q9BT88 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYT11Q9BT88 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYT11Q9BT88 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYT11Q9BT88 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYT11Q9BT88 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYT11Q9BT88 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SYT11Q9BT88 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYT11Q9BT88 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYT11Q9BT88 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYT11Q9BT88 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYT11Q9BT88 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYT11Q9BT88 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYT11Q9BT88 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYT11Q9BT88 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYT11Q9BT88 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SYT11Q9BT88 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SYT11Q9BT88 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYT11Q9BT88 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYT11Q9BT88 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYT11Q9BT88 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYT11Q9BT88 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYT11Q9BT88 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYT11Q9BT88 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYT11Q9BT88 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYT11Q9BT88 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYT11Q9BT88 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYT11Q9BT88 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYT11Q9BT88 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYT11Q9BT88 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYT11Q9BT88 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYT11Q9BT88 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYT11Q9BT88 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYT11Q9BT88 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYT11Q9BT88 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYT11Q9BT88 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SYT11Q9BT88 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYT11Q9BT88 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYT11Q9BT88 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYT11Q9BT88 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYT11Q9BT88 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYT11Q9BT88 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYT11Q9BT88 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SYT11Q9BT88 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYT11Q9BT88 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYT11Q9BT88 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYT11Q9BT88 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYT11Q9BT88 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYT11Q9BT88 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYT11Q9BT88 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYT11Q9BT88 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYT11Q9BT88 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYT11Q9BT88 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYT11Q9BT88 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYT11Q9BT88 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYT11Q9BT88 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYT11Q9BT88 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYT11Q9BT88 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYT11Q9BT88 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYT11Q9BT88 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYT11Q9BT88 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SYT11Q9BT88 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYT11Q9BT88 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYT11Q9BT88 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SYT11Q9BT88 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYT11Q9BT88 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SYT11Q9BT88 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYT11Q9BT88 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYT11Q9BT88 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYT11Q9BT88 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYT11Q9BT88 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYT11Q9BT88 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYT11Q9BT88 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYT11Q9BT88 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYT11Q9BT88 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYT11Q9BT88 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYT11Q9BT88 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYT11Q9BT88 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SYT11Q9BT88 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYT11Q9BT88 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms