Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RTKNQ9BST9 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RTKNQ9BST9 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RTKNQ9BST9 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RTKNQ9BST9 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RTKNQ9BST9 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RTKNQ9BST9 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RTKNQ9BST9 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
RTKNQ9BST9 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RTKNQ9BST9 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RTKNQ9BST9 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RTKNQ9BST9 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RTKNQ9BST9 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RTKNQ9BST9 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RTKNQ9BST9 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RTKNQ9BST9 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RTKNQ9BST9 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RTKNQ9BST9 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RTKNQ9BST9 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RTKNQ9BST9 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RTKNQ9BST9 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RTKNQ9BST9 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RTKNQ9BST9 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RTKNQ9BST9 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RTKNQ9BST9 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RTKNQ9BST9 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
RTKNQ9BST9 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RTKNQ9BST9 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RTKNQ9BST9 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
RTKNQ9BST9 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RTKNQ9BST9 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RTKNQ9BST9 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RTKNQ9BST9 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RTKNQ9BST9 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RTKNQ9BST9 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RTKNQ9BST9 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RTKNQ9BST9 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RTKNQ9BST9 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RTKNQ9BST9 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RTKNQ9BST9 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RTKNQ9BST9 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RTKNQ9BST9 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RTKNQ9BST9 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RTKNQ9BST9 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RTKNQ9BST9 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RTKNQ9BST9 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RTKNQ9BST9 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RTKNQ9BST9 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RTKNQ9BST9 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RTKNQ9BST9 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RTKNQ9BST9 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RTKNQ9BST9 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RTKNQ9BST9 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RTKNQ9BST9 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RTKNQ9BST9 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RTKNQ9BST9 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RTKNQ9BST9 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RTKNQ9BST9 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RTKNQ9BST9 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RTKNQ9BST9 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
RTKNQ9BST9 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RTKNQ9BST9 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RTKNQ9BST9 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RTKNQ9BST9 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RTKNQ9BST9 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RTKNQ9BST9 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RTKNQ9BST9 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RTKNQ9BST9 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RTKNQ9BST9 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RTKNQ9BST9 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RTKNQ9BST9 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RTKNQ9BST9 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RTKNQ9BST9 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RTKNQ9BST9 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RTKNQ9BST9 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RTKNQ9BST9 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RTKNQ9BST9 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RTKNQ9BST9 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RTKNQ9BST9 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RTKNQ9BST9 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RTKNQ9BST9 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RTKNQ9BST9 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RTKNQ9BST9 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
RTKNQ9BST9 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RTKNQ9BST9 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RTKNQ9BST9 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RTKNQ9BST9 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RTKNQ9BST9 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RTKNQ9BST9 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RTKNQ9BST9 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RTKNQ9BST9 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RTKNQ9BST9 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RTKNQ9BST9 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
RTKNQ9BST9 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RTKNQ9BST9 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
RTKNQ9BST9 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
RTKNQ9BST9 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RTKNQ9BST9 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RTKNQ9BST9 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RTKNQ9BST9 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms