Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS92

NIPSNAP3B, Protein NipSnap homolog 3B, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3BQ9BS92 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms