Protein–RNA interactions for Protein: Q99990

VGLL1, Transcription cofactor vestigial-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL1Q99990 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VGLL1Q99990 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms