Protein–RNA interactions for Protein: Q99967

CITED2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED2Q99967 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms