Protein–RNA interactions for Protein: Q96SN8

CDK5RAP2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP2Q96SN8 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK5RAP2Q96SN8 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK5RAP2Q96SN8 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK5RAP2Q96SN8 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK5RAP2Q96SN8 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK5RAP2Q96SN8 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK5RAP2Q96SN8 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK5RAP2Q96SN8 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK5RAP2Q96SN8 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK5RAP2Q96SN8 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK5RAP2Q96SN8 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK5RAP2Q96SN8 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK5RAP2Q96SN8 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK5RAP2Q96SN8 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK5RAP2Q96SN8 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK5RAP2Q96SN8 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK5RAP2Q96SN8 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK5RAP2Q96SN8 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK5RAP2Q96SN8 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK5RAP2Q96SN8 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK5RAP2Q96SN8 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK5RAP2Q96SN8 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK5RAP2Q96SN8 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK5RAP2Q96SN8 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK5RAP2Q96SN8 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK5RAP2Q96SN8 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK5RAP2Q96SN8 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK5RAP2Q96SN8 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK5RAP2Q96SN8 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK5RAP2Q96SN8 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK5RAP2Q96SN8 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK5RAP2Q96SN8 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK5RAP2Q96SN8 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK5RAP2Q96SN8 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK5RAP2Q96SN8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDK5RAP2Q96SN8 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDK5RAP2Q96SN8 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDK5RAP2Q96SN8 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDK5RAP2Q96SN8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDK5RAP2Q96SN8 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDK5RAP2Q96SN8 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDK5RAP2Q96SN8 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDK5RAP2Q96SN8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDK5RAP2Q96SN8 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDK5RAP2Q96SN8 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDK5RAP2Q96SN8 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDK5RAP2Q96SN8 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDK5RAP2Q96SN8 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDK5RAP2Q96SN8 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDK5RAP2Q96SN8 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CDK5RAP2Q96SN8 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CDK5RAP2Q96SN8 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK5RAP2Q96SN8 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK5RAP2Q96SN8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK5RAP2Q96SN8 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK5RAP2Q96SN8 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK5RAP2Q96SN8 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK5RAP2Q96SN8 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK5RAP2Q96SN8 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK5RAP2Q96SN8 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK5RAP2Q96SN8 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK5RAP2Q96SN8 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK5RAP2Q96SN8 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK5RAP2Q96SN8 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK5RAP2Q96SN8 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK5RAP2Q96SN8 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK5RAP2Q96SN8 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK5RAP2Q96SN8 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK5RAP2Q96SN8 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK5RAP2Q96SN8 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK5RAP2Q96SN8 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK5RAP2Q96SN8 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK5RAP2Q96SN8 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK5RAP2Q96SN8 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK5RAP2Q96SN8 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK5RAP2Q96SN8 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK5RAP2Q96SN8 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK5RAP2Q96SN8 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK5RAP2Q96SN8 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK5RAP2Q96SN8 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK5RAP2Q96SN8 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK5RAP2Q96SN8 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK5RAP2Q96SN8 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK5RAP2Q96SN8 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK5RAP2Q96SN8 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK5RAP2Q96SN8 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK5RAP2Q96SN8 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK5RAP2Q96SN8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK5RAP2Q96SN8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK5RAP2Q96SN8 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK5RAP2Q96SN8 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK5RAP2Q96SN8 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK5RAP2Q96SN8 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK5RAP2Q96SN8 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK5RAP2Q96SN8 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK5RAP2Q96SN8 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK5RAP2Q96SN8 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK5RAP2Q96SN8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK5RAP2Q96SN8 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms