Protein–RNA interactions for Protein: Q96RJ3

TNFRSF13C, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF13CQ96RJ3 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFRSF13CQ96RJ3 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFRSF13CQ96RJ3 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFRSF13CQ96RJ3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFRSF13CQ96RJ3 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFRSF13CQ96RJ3 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFRSF13CQ96RJ3 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFRSF13CQ96RJ3 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFRSF13CQ96RJ3 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFRSF13CQ96RJ3 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFRSF13CQ96RJ3 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFRSF13CQ96RJ3 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFRSF13CQ96RJ3 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFRSF13CQ96RJ3 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFRSF13CQ96RJ3 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFRSF13CQ96RJ3 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFRSF13CQ96RJ3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFRSF13CQ96RJ3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFRSF13CQ96RJ3 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFRSF13CQ96RJ3 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFRSF13CQ96RJ3 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFRSF13CQ96RJ3 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFRSF13CQ96RJ3 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFRSF13CQ96RJ3 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFRSF13CQ96RJ3 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFRSF13CQ96RJ3 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFRSF13CQ96RJ3 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFRSF13CQ96RJ3 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFRSF13CQ96RJ3 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFRSF13CQ96RJ3 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFRSF13CQ96RJ3 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFRSF13CQ96RJ3 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFRSF13CQ96RJ3 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFRSF13CQ96RJ3 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFRSF13CQ96RJ3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFRSF13CQ96RJ3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFRSF13CQ96RJ3 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFRSF13CQ96RJ3 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFRSF13CQ96RJ3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFRSF13CQ96RJ3 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFRSF13CQ96RJ3 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFRSF13CQ96RJ3 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFRSF13CQ96RJ3 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFRSF13CQ96RJ3 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFRSF13CQ96RJ3 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFRSF13CQ96RJ3 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFRSF13CQ96RJ3 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFRSF13CQ96RJ3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFRSF13CQ96RJ3 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFRSF13CQ96RJ3 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFRSF13CQ96RJ3 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFRSF13CQ96RJ3 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFRSF13CQ96RJ3 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFRSF13CQ96RJ3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFRSF13CQ96RJ3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFRSF13CQ96RJ3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFRSF13CQ96RJ3 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFRSF13CQ96RJ3 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFRSF13CQ96RJ3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFRSF13CQ96RJ3 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFRSF13CQ96RJ3 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFRSF13CQ96RJ3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFRSF13CQ96RJ3 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFRSF13CQ96RJ3 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFRSF13CQ96RJ3 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFRSF13CQ96RJ3 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFRSF13CQ96RJ3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFRSF13CQ96RJ3 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFRSF13CQ96RJ3 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFRSF13CQ96RJ3 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFRSF13CQ96RJ3 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFRSF13CQ96RJ3 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFRSF13CQ96RJ3 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFRSF13CQ96RJ3 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFRSF13CQ96RJ3 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFRSF13CQ96RJ3 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFRSF13CQ96RJ3 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFRSF13CQ96RJ3 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFRSF13CQ96RJ3 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFRSF13CQ96RJ3 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFRSF13CQ96RJ3 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TNFRSF13CQ96RJ3 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TNFRSF13CQ96RJ3 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNFRSF13CQ96RJ3 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNFRSF13CQ96RJ3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNFRSF13CQ96RJ3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNFRSF13CQ96RJ3 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNFRSF13CQ96RJ3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNFRSF13CQ96RJ3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNFRSF13CQ96RJ3 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNFRSF13CQ96RJ3 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNFRSF13CQ96RJ3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNFRSF13CQ96RJ3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TNFRSF13CQ96RJ3 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNFRSF13CQ96RJ3 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TNFRSF13CQ96RJ3 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNFRSF13CQ96RJ3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms