Protein–RNA interactions for Protein: Q96PX6

CCDC85A, Coiled-coil domain-containing protein 85A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85AQ96PX6 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC85AQ96PX6 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC85AQ96PX6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC85AQ96PX6 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC85AQ96PX6 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC85AQ96PX6 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC85AQ96PX6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC85AQ96PX6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC85AQ96PX6 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC85AQ96PX6 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC85AQ96PX6 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC85AQ96PX6 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC85AQ96PX6 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC85AQ96PX6 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC85AQ96PX6 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC85AQ96PX6 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC85AQ96PX6 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC85AQ96PX6 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC85AQ96PX6 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC85AQ96PX6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC85AQ96PX6 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC85AQ96PX6 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC85AQ96PX6 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC85AQ96PX6 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC85AQ96PX6 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC85AQ96PX6 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC85AQ96PX6 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC85AQ96PX6 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC85AQ96PX6 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC85AQ96PX6 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC85AQ96PX6 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC85AQ96PX6 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC85AQ96PX6 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC85AQ96PX6 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC85AQ96PX6 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC85AQ96PX6 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC85AQ96PX6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC85AQ96PX6 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC85AQ96PX6 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC85AQ96PX6 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC85AQ96PX6 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC85AQ96PX6 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC85AQ96PX6 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC85AQ96PX6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC85AQ96PX6 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC85AQ96PX6 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC85AQ96PX6 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC85AQ96PX6 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC85AQ96PX6 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC85AQ96PX6 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC85AQ96PX6 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC85AQ96PX6 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC85AQ96PX6 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC85AQ96PX6 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC85AQ96PX6 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC85AQ96PX6 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC85AQ96PX6 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC85AQ96PX6 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC85AQ96PX6 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC85AQ96PX6 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC85AQ96PX6 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC85AQ96PX6 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC85AQ96PX6 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC85AQ96PX6 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC85AQ96PX6 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC85AQ96PX6 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC85AQ96PX6 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC85AQ96PX6 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC85AQ96PX6 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC85AQ96PX6 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC85AQ96PX6 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC85AQ96PX6 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC85AQ96PX6 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC85AQ96PX6 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC85AQ96PX6 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC85AQ96PX6 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC85AQ96PX6 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC85AQ96PX6 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC85AQ96PX6 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC85AQ96PX6 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC85AQ96PX6 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC85AQ96PX6 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC85AQ96PX6 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC85AQ96PX6 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC85AQ96PX6 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC85AQ96PX6 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC85AQ96PX6 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC85AQ96PX6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC85AQ96PX6 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC85AQ96PX6 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC85AQ96PX6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC85AQ96PX6 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC85AQ96PX6 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC85AQ96PX6 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC85AQ96PX6 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC85AQ96PX6 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC85AQ96PX6 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC85AQ96PX6 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC85AQ96PX6 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC85AQ96PX6 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms