Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA8

TSNARE1, t-SNARE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1Q96NA8 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TSNARE1Q96NA8 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TSNARE1Q96NA8 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TSNARE1Q96NA8 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TSNARE1Q96NA8 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TSNARE1Q96NA8 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TSNARE1Q96NA8 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TSNARE1Q96NA8 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TSNARE1Q96NA8 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TSNARE1Q96NA8 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TSNARE1Q96NA8 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TSNARE1Q96NA8 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TSNARE1Q96NA8 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TSNARE1Q96NA8 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TSNARE1Q96NA8 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TSNARE1Q96NA8 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TSNARE1Q96NA8 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TSNARE1Q96NA8 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TSNARE1Q96NA8 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TSNARE1Q96NA8 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TSNARE1Q96NA8 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TSNARE1Q96NA8 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TSNARE1Q96NA8 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TSNARE1Q96NA8 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TSNARE1Q96NA8 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TSNARE1Q96NA8 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TSNARE1Q96NA8 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TSNARE1Q96NA8 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TSNARE1Q96NA8 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TSNARE1Q96NA8 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TSNARE1Q96NA8 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TSNARE1Q96NA8 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TSNARE1Q96NA8 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TSNARE1Q96NA8 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TSNARE1Q96NA8 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TSNARE1Q96NA8 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TSNARE1Q96NA8 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TSNARE1Q96NA8 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TSNARE1Q96NA8 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TSNARE1Q96NA8 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TSNARE1Q96NA8 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TSNARE1Q96NA8 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TSNARE1Q96NA8 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TSNARE1Q96NA8 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TSNARE1Q96NA8 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TSNARE1Q96NA8 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TSNARE1Q96NA8 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TSNARE1Q96NA8 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TSNARE1Q96NA8 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TSNARE1Q96NA8 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TSNARE1Q96NA8 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TSNARE1Q96NA8 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TSNARE1Q96NA8 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TSNARE1Q96NA8 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TSNARE1Q96NA8 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TSNARE1Q96NA8 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TSNARE1Q96NA8 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TSNARE1Q96NA8 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TSNARE1Q96NA8 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TSNARE1Q96NA8 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TSNARE1Q96NA8 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TSNARE1Q96NA8 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TSNARE1Q96NA8 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TSNARE1Q96NA8 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TSNARE1Q96NA8 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TSNARE1Q96NA8 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TSNARE1Q96NA8 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TSNARE1Q96NA8 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TSNARE1Q96NA8 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TSNARE1Q96NA8 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TSNARE1Q96NA8 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TSNARE1Q96NA8 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TSNARE1Q96NA8 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TSNARE1Q96NA8 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TSNARE1Q96NA8 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TSNARE1Q96NA8 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TSNARE1Q96NA8 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TSNARE1Q96NA8 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TSNARE1Q96NA8 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TSNARE1Q96NA8 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TSNARE1Q96NA8 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TSNARE1Q96NA8 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TSNARE1Q96NA8 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TSNARE1Q96NA8 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TSNARE1Q96NA8 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TSNARE1Q96NA8 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TSNARE1Q96NA8 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TSNARE1Q96NA8 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TSNARE1Q96NA8 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TSNARE1Q96NA8 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TSNARE1Q96NA8 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TSNARE1Q96NA8 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TSNARE1Q96NA8 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TSNARE1Q96NA8 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TSNARE1Q96NA8 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TSNARE1Q96NA8 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TSNARE1Q96NA8 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TSNARE1Q96NA8 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TSNARE1Q96NA8 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TSNARE1Q96NA8 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms