Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FGD4Q96M96 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FGD4Q96M96 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FGD4Q96M96 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FGD4Q96M96 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FGD4Q96M96 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FGD4Q96M96 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FGD4Q96M96 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FGD4Q96M96 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FGD4Q96M96 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FGD4Q96M96 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FGD4Q96M96 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FGD4Q96M96 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FGD4Q96M96 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FGD4Q96M96 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FGD4Q96M96 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FGD4Q96M96 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FGD4Q96M96 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FGD4Q96M96 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FGD4Q96M96 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FGD4Q96M96 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FGD4Q96M96 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
FGD4Q96M96 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FGD4Q96M96 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FGD4Q96M96 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FGD4Q96M96 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
FGD4Q96M96 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FGD4Q96M96 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FGD4Q96M96 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FGD4Q96M96 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
FGD4Q96M96 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FGD4Q96M96 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FGD4Q96M96 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FGD4Q96M96 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FGD4Q96M96 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FGD4Q96M96 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FGD4Q96M96 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FGD4Q96M96 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
FGD4Q96M96 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FGD4Q96M96 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
FGD4Q96M96 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FGD4Q96M96 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FGD4Q96M96 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FGD4Q96M96 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FGD4Q96M96 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FGD4Q96M96 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FGD4Q96M96 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FGD4Q96M96 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FGD4Q96M96 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FGD4Q96M96 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FGD4Q96M96 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FGD4Q96M96 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FGD4Q96M96 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FGD4Q96M96 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FGD4Q96M96 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FGD4Q96M96 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FGD4Q96M96 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FGD4Q96M96 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FGD4Q96M96 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FGD4Q96M96 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FGD4Q96M96 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FGD4Q96M96 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FGD4Q96M96 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FGD4Q96M96 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FGD4Q96M96 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FGD4Q96M96 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FGD4Q96M96 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FGD4Q96M96 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FGD4Q96M96 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FGD4Q96M96 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FGD4Q96M96 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FGD4Q96M96 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FGD4Q96M96 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FGD4Q96M96 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FGD4Q96M96 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FGD4Q96M96 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FGD4Q96M96 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FGD4Q96M96 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FGD4Q96M96 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FGD4Q96M96 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FGD4Q96M96 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FGD4Q96M96 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
FGD4Q96M96 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FGD4Q96M96 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FGD4Q96M96 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
FGD4Q96M96 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
FGD4Q96M96 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FGD4Q96M96 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FGD4Q96M96 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FGD4Q96M96 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FGD4Q96M96 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FGD4Q96M96 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FGD4Q96M96 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FGD4Q96M96 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FGD4Q96M96 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FGD4Q96M96 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FGD4Q96M96 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FGD4Q96M96 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FGD4Q96M96 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FGD4Q96M96 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms