Protein–RNA interactions for Protein: Q96M63

CCDC114, Coiled-coil domain-containing protein 114, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC114Q96M63 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC114Q96M63 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC114Q96M63 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC114Q96M63 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC114Q96M63 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC114Q96M63 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC114Q96M63 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC114Q96M63 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC114Q96M63 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC114Q96M63 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC114Q96M63 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC114Q96M63 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC114Q96M63 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC114Q96M63 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC114Q96M63 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC114Q96M63 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC114Q96M63 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC114Q96M63 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC114Q96M63 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC114Q96M63 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC114Q96M63 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC114Q96M63 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC114Q96M63 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC114Q96M63 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC114Q96M63 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC114Q96M63 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC114Q96M63 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC114Q96M63 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC114Q96M63 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC114Q96M63 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC114Q96M63 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC114Q96M63 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC114Q96M63 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC114Q96M63 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC114Q96M63 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC114Q96M63 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC114Q96M63 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC114Q96M63 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC114Q96M63 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC114Q96M63 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC114Q96M63 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC114Q96M63 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC114Q96M63 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC114Q96M63 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC114Q96M63 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC114Q96M63 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC114Q96M63 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC114Q96M63 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC114Q96M63 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC114Q96M63 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC114Q96M63 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC114Q96M63 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC114Q96M63 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC114Q96M63 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC114Q96M63 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC114Q96M63 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC114Q96M63 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC114Q96M63 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC114Q96M63 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC114Q96M63 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC114Q96M63 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC114Q96M63 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC114Q96M63 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC114Q96M63 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC114Q96M63 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC114Q96M63 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC114Q96M63 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC114Q96M63 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC114Q96M63 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC114Q96M63 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC114Q96M63 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC114Q96M63 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC114Q96M63 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC114Q96M63 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC114Q96M63 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC114Q96M63 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC114Q96M63 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC114Q96M63 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC114Q96M63 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC114Q96M63 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC114Q96M63 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC114Q96M63 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC114Q96M63 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC114Q96M63 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC114Q96M63 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC114Q96M63 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC114Q96M63 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC114Q96M63 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC114Q96M63 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC114Q96M63 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC114Q96M63 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC114Q96M63 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC114Q96M63 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC114Q96M63 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC114Q96M63 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC114Q96M63 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms