Protein–RNA interactions for Protein: Q96M60

FAM227B, Protein FAM227B, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227BQ96M60 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM227BQ96M60 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM227BQ96M60 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM227BQ96M60 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM227BQ96M60 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM227BQ96M60 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM227BQ96M60 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM227BQ96M60 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM227BQ96M60 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM227BQ96M60 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM227BQ96M60 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM227BQ96M60 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM227BQ96M60 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM227BQ96M60 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM227BQ96M60 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM227BQ96M60 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM227BQ96M60 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM227BQ96M60 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM227BQ96M60 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM227BQ96M60 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM227BQ96M60 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM227BQ96M60 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM227BQ96M60 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM227BQ96M60 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM227BQ96M60 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM227BQ96M60 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM227BQ96M60 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM227BQ96M60 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM227BQ96M60 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM227BQ96M60 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM227BQ96M60 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM227BQ96M60 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM227BQ96M60 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM227BQ96M60 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM227BQ96M60 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM227BQ96M60 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM227BQ96M60 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM227BQ96M60 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM227BQ96M60 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM227BQ96M60 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM227BQ96M60 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM227BQ96M60 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM227BQ96M60 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM227BQ96M60 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM227BQ96M60 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM227BQ96M60 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM227BQ96M60 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM227BQ96M60 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM227BQ96M60 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM227BQ96M60 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM227BQ96M60 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM227BQ96M60 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM227BQ96M60 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM227BQ96M60 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM227BQ96M60 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM227BQ96M60 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM227BQ96M60 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM227BQ96M60 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM227BQ96M60 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM227BQ96M60 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM227BQ96M60 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM227BQ96M60 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
FAM227BQ96M60 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FAM227BQ96M60 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
FAM227BQ96M60 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FAM227BQ96M60 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FAM227BQ96M60 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FAM227BQ96M60 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
FAM227BQ96M60 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FAM227BQ96M60 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
FAM227BQ96M60 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FAM227BQ96M60 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FAM227BQ96M60 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FAM227BQ96M60 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FAM227BQ96M60 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FAM227BQ96M60 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FAM227BQ96M60 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FAM227BQ96M60 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM227BQ96M60 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM227BQ96M60 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM227BQ96M60 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM227BQ96M60 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM227BQ96M60 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM227BQ96M60 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM227BQ96M60 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM227BQ96M60 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM227BQ96M60 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM227BQ96M60 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM227BQ96M60 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM227BQ96M60 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM227BQ96M60 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM227BQ96M60 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM227BQ96M60 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM227BQ96M60 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM227BQ96M60 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM227BQ96M60 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM227BQ96M60 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM227BQ96M60 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM227BQ96M60 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM227BQ96M60 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms