Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR5

UBE2E2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E2Q96LR5 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2E2Q96LR5 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2E2Q96LR5 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2E2Q96LR5 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2E2Q96LR5 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2E2Q96LR5 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2E2Q96LR5 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2E2Q96LR5 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2E2Q96LR5 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2E2Q96LR5 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2E2Q96LR5 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2E2Q96LR5 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2E2Q96LR5 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2E2Q96LR5 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2E2Q96LR5 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2E2Q96LR5 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2E2Q96LR5 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2E2Q96LR5 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2E2Q96LR5 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2E2Q96LR5 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2E2Q96LR5 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2E2Q96LR5 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2E2Q96LR5 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2E2Q96LR5 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2E2Q96LR5 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2E2Q96LR5 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2E2Q96LR5 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2E2Q96LR5 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2E2Q96LR5 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2E2Q96LR5 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2E2Q96LR5 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2E2Q96LR5 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2E2Q96LR5 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2E2Q96LR5 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2E2Q96LR5 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2E2Q96LR5 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2E2Q96LR5 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2E2Q96LR5 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2E2Q96LR5 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2E2Q96LR5 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2E2Q96LR5 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2E2Q96LR5 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2E2Q96LR5 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2E2Q96LR5 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2E2Q96LR5 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2E2Q96LR5 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2E2Q96LR5 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2E2Q96LR5 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2E2Q96LR5 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2E2Q96LR5 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2E2Q96LR5 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2E2Q96LR5 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2E2Q96LR5 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2E2Q96LR5 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2E2Q96LR5 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2E2Q96LR5 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2E2Q96LR5 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2E2Q96LR5 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2E2Q96LR5 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2E2Q96LR5 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2E2Q96LR5 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2E2Q96LR5 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2E2Q96LR5 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2E2Q96LR5 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2E2Q96LR5 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2E2Q96LR5 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2E2Q96LR5 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2E2Q96LR5 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2E2Q96LR5 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2E2Q96LR5 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2E2Q96LR5 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2E2Q96LR5 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2E2Q96LR5 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2E2Q96LR5 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2E2Q96LR5 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2E2Q96LR5 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2E2Q96LR5 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2E2Q96LR5 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2E2Q96LR5 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2E2Q96LR5 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2E2Q96LR5 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2E2Q96LR5 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2E2Q96LR5 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2E2Q96LR5 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2E2Q96LR5 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2E2Q96LR5 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2E2Q96LR5 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2E2Q96LR5 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2E2Q96LR5 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2E2Q96LR5 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2E2Q96LR5 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2E2Q96LR5 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2E2Q96LR5 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2E2Q96LR5 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2E2Q96LR5 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2E2Q96LR5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2E2Q96LR5 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2E2Q96LR5 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2E2Q96LR5 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2E2Q96LR5 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms