Protein–RNA interactions for Protein: Q96LL4

C8orf48, Uncharacterized protein C8orf48, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf48Q96LL4 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C8orf48Q96LL4 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C8orf48Q96LL4 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
C8orf48Q96LL4 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
C8orf48Q96LL4 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
C8orf48Q96LL4 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
C8orf48Q96LL4 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
C8orf48Q96LL4 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
C8orf48Q96LL4 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
C8orf48Q96LL4 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C8orf48Q96LL4 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C8orf48Q96LL4 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
C8orf48Q96LL4 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C8orf48Q96LL4 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C8orf48Q96LL4 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C8orf48Q96LL4 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C8orf48Q96LL4 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C8orf48Q96LL4 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C8orf48Q96LL4 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
C8orf48Q96LL4 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
C8orf48Q96LL4 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.3■■□□□ 1
C8orf48Q96LL4 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.3■■□□□ 1
C8orf48Q96LL4 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
C8orf48Q96LL4 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C8orf48Q96LL4 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
C8orf48Q96LL4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C8orf48Q96LL4 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C8orf48Q96LL4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C8orf48Q96LL4 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
C8orf48Q96LL4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
C8orf48Q96LL4 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C8orf48Q96LL4 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C8orf48Q96LL4 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C8orf48Q96LL4 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C8orf48Q96LL4 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C8orf48Q96LL4 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C8orf48Q96LL4 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C8orf48Q96LL4 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C8orf48Q96LL4 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C8orf48Q96LL4 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
C8orf48Q96LL4 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C8orf48Q96LL4 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C8orf48Q96LL4 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C8orf48Q96LL4 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
C8orf48Q96LL4 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.29■■□□□ 1
C8orf48Q96LL4 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
C8orf48Q96LL4 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C8orf48Q96LL4 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C8orf48Q96LL4 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C8orf48Q96LL4 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
C8orf48Q96LL4 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C8orf48Q96LL4 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.28■■□□□ 1
C8orf48Q96LL4 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
C8orf48Q96LL4 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C8orf48Q96LL4 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C8orf48Q96LL4 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C8orf48Q96LL4 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
C8orf48Q96LL4 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
C8orf48Q96LL4 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.28■■□□□ 1
C8orf48Q96LL4 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
C8orf48Q96LL4 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
C8orf48Q96LL4 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C8orf48Q96LL4 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
C8orf48Q96LL4 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
C8orf48Q96LL4 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
C8orf48Q96LL4 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C8orf48Q96LL4 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C8orf48Q96LL4 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C8orf48Q96LL4 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C8orf48Q96LL4 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
C8orf48Q96LL4 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
C8orf48Q96LL4 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C8orf48Q96LL4 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C8orf48Q96LL4 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C8orf48Q96LL4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C8orf48Q96LL4 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C8orf48Q96LL4 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
C8orf48Q96LL4 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.27■■□□□ 1
C8orf48Q96LL4 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.27■■□□□ 1
C8orf48Q96LL4 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
C8orf48Q96LL4 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
C8orf48Q96LL4 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
C8orf48Q96LL4 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C8orf48Q96LL4 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
C8orf48Q96LL4 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
C8orf48Q96LL4 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
C8orf48Q96LL4 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C8orf48Q96LL4 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C8orf48Q96LL4 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C8orf48Q96LL4 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C8orf48Q96LL4 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C8orf48Q96LL4 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C8orf48Q96LL4 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C8orf48Q96LL4 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C8orf48Q96LL4 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
C8orf48Q96LL4 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C8orf48Q96LL4 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C8orf48Q96LL4 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C8orf48Q96LL4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C8orf48Q96LL4 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms