Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN3

PKNOX2, Homeobox protein PKNOX2, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2Q96KN3 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PKNOX2Q96KN3 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PKNOX2Q96KN3 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PKNOX2Q96KN3 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PKNOX2Q96KN3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PKNOX2Q96KN3 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PKNOX2Q96KN3 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PKNOX2Q96KN3 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PKNOX2Q96KN3 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PKNOX2Q96KN3 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PKNOX2Q96KN3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PKNOX2Q96KN3 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PKNOX2Q96KN3 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PKNOX2Q96KN3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PKNOX2Q96KN3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PKNOX2Q96KN3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PKNOX2Q96KN3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PKNOX2Q96KN3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PKNOX2Q96KN3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PKNOX2Q96KN3 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PKNOX2Q96KN3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PKNOX2Q96KN3 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PKNOX2Q96KN3 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PKNOX2Q96KN3 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PKNOX2Q96KN3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PKNOX2Q96KN3 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PKNOX2Q96KN3 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PKNOX2Q96KN3 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PKNOX2Q96KN3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PKNOX2Q96KN3 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PKNOX2Q96KN3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PKNOX2Q96KN3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PKNOX2Q96KN3 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PKNOX2Q96KN3 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PKNOX2Q96KN3 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PKNOX2Q96KN3 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PKNOX2Q96KN3 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PKNOX2Q96KN3 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PKNOX2Q96KN3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PKNOX2Q96KN3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PKNOX2Q96KN3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PKNOX2Q96KN3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PKNOX2Q96KN3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PKNOX2Q96KN3 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PKNOX2Q96KN3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PKNOX2Q96KN3 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PKNOX2Q96KN3 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PKNOX2Q96KN3 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PKNOX2Q96KN3 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PKNOX2Q96KN3 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PKNOX2Q96KN3 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PKNOX2Q96KN3 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PKNOX2Q96KN3 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PKNOX2Q96KN3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PKNOX2Q96KN3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PKNOX2Q96KN3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PKNOX2Q96KN3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PKNOX2Q96KN3 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PKNOX2Q96KN3 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PKNOX2Q96KN3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PKNOX2Q96KN3 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PKNOX2Q96KN3 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PKNOX2Q96KN3 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PKNOX2Q96KN3 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PKNOX2Q96KN3 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PKNOX2Q96KN3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PKNOX2Q96KN3 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PKNOX2Q96KN3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PKNOX2Q96KN3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PKNOX2Q96KN3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PKNOX2Q96KN3 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PKNOX2Q96KN3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PKNOX2Q96KN3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PKNOX2Q96KN3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PKNOX2Q96KN3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PKNOX2Q96KN3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PKNOX2Q96KN3 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PKNOX2Q96KN3 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PKNOX2Q96KN3 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PKNOX2Q96KN3 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PKNOX2Q96KN3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PKNOX2Q96KN3 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PKNOX2Q96KN3 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PKNOX2Q96KN3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PKNOX2Q96KN3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PKNOX2Q96KN3 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PKNOX2Q96KN3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PKNOX2Q96KN3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PKNOX2Q96KN3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PKNOX2Q96KN3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PKNOX2Q96KN3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PKNOX2Q96KN3 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PKNOX2Q96KN3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PKNOX2Q96KN3 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PKNOX2Q96KN3 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PKNOX2Q96KN3 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PKNOX2Q96KN3 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PKNOX2Q96KN3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PKNOX2Q96KN3 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PKNOX2Q96KN3 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms