Protein–RNA interactions for Protein: Q96JY6

PDLIM2, PDZ and LIM domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM2Q96JY6 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDLIM2Q96JY6 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDLIM2Q96JY6 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDLIM2Q96JY6 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDLIM2Q96JY6 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDLIM2Q96JY6 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDLIM2Q96JY6 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDLIM2Q96JY6 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDLIM2Q96JY6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDLIM2Q96JY6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDLIM2Q96JY6 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PDLIM2Q96JY6 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PDLIM2Q96JY6 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDLIM2Q96JY6 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDLIM2Q96JY6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDLIM2Q96JY6 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDLIM2Q96JY6 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDLIM2Q96JY6 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDLIM2Q96JY6 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDLIM2Q96JY6 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDLIM2Q96JY6 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDLIM2Q96JY6 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDLIM2Q96JY6 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDLIM2Q96JY6 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDLIM2Q96JY6 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDLIM2Q96JY6 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDLIM2Q96JY6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDLIM2Q96JY6 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDLIM2Q96JY6 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDLIM2Q96JY6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDLIM2Q96JY6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDLIM2Q96JY6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDLIM2Q96JY6 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDLIM2Q96JY6 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDLIM2Q96JY6 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDLIM2Q96JY6 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDLIM2Q96JY6 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDLIM2Q96JY6 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDLIM2Q96JY6 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PDLIM2Q96JY6 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDLIM2Q96JY6 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDLIM2Q96JY6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDLIM2Q96JY6 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDLIM2Q96JY6 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDLIM2Q96JY6 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDLIM2Q96JY6 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDLIM2Q96JY6 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDLIM2Q96JY6 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDLIM2Q96JY6 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDLIM2Q96JY6 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PDLIM2Q96JY6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDLIM2Q96JY6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PDLIM2Q96JY6 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDLIM2Q96JY6 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDLIM2Q96JY6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDLIM2Q96JY6 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDLIM2Q96JY6 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDLIM2Q96JY6 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDLIM2Q96JY6 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDLIM2Q96JY6 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDLIM2Q96JY6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDLIM2Q96JY6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDLIM2Q96JY6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDLIM2Q96JY6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDLIM2Q96JY6 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDLIM2Q96JY6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDLIM2Q96JY6 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDLIM2Q96JY6 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDLIM2Q96JY6 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDLIM2Q96JY6 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDLIM2Q96JY6 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDLIM2Q96JY6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDLIM2Q96JY6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDLIM2Q96JY6 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDLIM2Q96JY6 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDLIM2Q96JY6 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDLIM2Q96JY6 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDLIM2Q96JY6 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDLIM2Q96JY6 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDLIM2Q96JY6 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDLIM2Q96JY6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDLIM2Q96JY6 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PDLIM2Q96JY6 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDLIM2Q96JY6 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PDLIM2Q96JY6 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDLIM2Q96JY6 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDLIM2Q96JY6 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDLIM2Q96JY6 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDLIM2Q96JY6 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDLIM2Q96JY6 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDLIM2Q96JY6 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PDLIM2Q96JY6 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDLIM2Q96JY6 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDLIM2Q96JY6 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDLIM2Q96JY6 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDLIM2Q96JY6 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDLIM2Q96JY6 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PDLIM2Q96JY6 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PDLIM2Q96JY6 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PDLIM2Q96JY6 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms