Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDK5RAP3Q96JB5 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDK5RAP3Q96JB5 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDK5RAP3Q96JB5 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDK5RAP3Q96JB5 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDK5RAP3Q96JB5 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDK5RAP3Q96JB5 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDK5RAP3Q96JB5 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDK5RAP3Q96JB5 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDK5RAP3Q96JB5 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDK5RAP3Q96JB5 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDK5RAP3Q96JB5 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDK5RAP3Q96JB5 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDK5RAP3Q96JB5 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDK5RAP3Q96JB5 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDK5RAP3Q96JB5 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CDK5RAP3Q96JB5 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDK5RAP3Q96JB5 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CDK5RAP3Q96JB5 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDK5RAP3Q96JB5 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK5RAP3Q96JB5 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK5RAP3Q96JB5 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK5RAP3Q96JB5 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK5RAP3Q96JB5 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK5RAP3Q96JB5 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK5RAP3Q96JB5 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK5RAP3Q96JB5 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK5RAP3Q96JB5 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK5RAP3Q96JB5 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK5RAP3Q96JB5 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK5RAP3Q96JB5 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK5RAP3Q96JB5 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK5RAP3Q96JB5 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK5RAP3Q96JB5 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK5RAP3Q96JB5 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK5RAP3Q96JB5 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK5RAP3Q96JB5 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK5RAP3Q96JB5 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK5RAP3Q96JB5 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK5RAP3Q96JB5 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK5RAP3Q96JB5 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK5RAP3Q96JB5 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK5RAP3Q96JB5 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK5RAP3Q96JB5 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK5RAP3Q96JB5 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK5RAP3Q96JB5 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK5RAP3Q96JB5 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK5RAP3Q96JB5 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK5RAP3Q96JB5 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK5RAP3Q96JB5 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK5RAP3Q96JB5 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK5RAP3Q96JB5 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK5RAP3Q96JB5 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK5RAP3Q96JB5 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK5RAP3Q96JB5 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK5RAP3Q96JB5 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK5RAP3Q96JB5 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK5RAP3Q96JB5 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK5RAP3Q96JB5 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK5RAP3Q96JB5 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK5RAP3Q96JB5 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK5RAP3Q96JB5 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK5RAP3Q96JB5 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK5RAP3Q96JB5 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK5RAP3Q96JB5 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK5RAP3Q96JB5 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK5RAP3Q96JB5 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK5RAP3Q96JB5 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK5RAP3Q96JB5 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK5RAP3Q96JB5 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK5RAP3Q96JB5 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK5RAP3Q96JB5 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK5RAP3Q96JB5 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK5RAP3Q96JB5 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK5RAP3Q96JB5 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK5RAP3Q96JB5 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK5RAP3Q96JB5 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK5RAP3Q96JB5 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK5RAP3Q96JB5 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK5RAP3Q96JB5 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK5RAP3Q96JB5 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK5RAP3Q96JB5 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK5RAP3Q96JB5 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK5RAP3Q96JB5 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK5RAP3Q96JB5 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK5RAP3Q96JB5 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK5RAP3Q96JB5 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK5RAP3Q96JB5 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK5RAP3Q96JB5 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK5RAP3Q96JB5 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms