Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
BORCS6Q96GS4 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BORCS6Q96GS4 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BORCS6Q96GS4 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BORCS6Q96GS4 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
BORCS6Q96GS4 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BORCS6Q96GS4 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
BORCS6Q96GS4 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BORCS6Q96GS4 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BORCS6Q96GS4 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BORCS6Q96GS4 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BORCS6Q96GS4 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BORCS6Q96GS4 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BORCS6Q96GS4 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BORCS6Q96GS4 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
BORCS6Q96GS4 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
BORCS6Q96GS4 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BORCS6Q96GS4 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BORCS6Q96GS4 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BORCS6Q96GS4 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BORCS6Q96GS4 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BORCS6Q96GS4 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BORCS6Q96GS4 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BORCS6Q96GS4 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BORCS6Q96GS4 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BORCS6Q96GS4 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BORCS6Q96GS4 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BORCS6Q96GS4 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BORCS6Q96GS4 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BORCS6Q96GS4 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BORCS6Q96GS4 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BORCS6Q96GS4 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BORCS6Q96GS4 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BORCS6Q96GS4 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
BORCS6Q96GS4 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
BORCS6Q96GS4 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BORCS6Q96GS4 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BORCS6Q96GS4 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BORCS6Q96GS4 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BORCS6Q96GS4 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BORCS6Q96GS4 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BORCS6Q96GS4 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BORCS6Q96GS4 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BORCS6Q96GS4 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BORCS6Q96GS4 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BORCS6Q96GS4 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BORCS6Q96GS4 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BORCS6Q96GS4 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BORCS6Q96GS4 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BORCS6Q96GS4 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BORCS6Q96GS4 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BORCS6Q96GS4 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BORCS6Q96GS4 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BORCS6Q96GS4 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
BORCS6Q96GS4 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BORCS6Q96GS4 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BORCS6Q96GS4 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
BORCS6Q96GS4 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BORCS6Q96GS4 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BORCS6Q96GS4 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BORCS6Q96GS4 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BORCS6Q96GS4 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BORCS6Q96GS4 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BORCS6Q96GS4 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BORCS6Q96GS4 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BORCS6Q96GS4 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BORCS6Q96GS4 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BORCS6Q96GS4 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BORCS6Q96GS4 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BORCS6Q96GS4 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BORCS6Q96GS4 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BORCS6Q96GS4 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BORCS6Q96GS4 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BORCS6Q96GS4 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BORCS6Q96GS4 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BORCS6Q96GS4 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BORCS6Q96GS4 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BORCS6Q96GS4 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BORCS6Q96GS4 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BORCS6Q96GS4 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BORCS6Q96GS4 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BORCS6Q96GS4 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BORCS6Q96GS4 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BORCS6Q96GS4 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BORCS6Q96GS4 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BORCS6Q96GS4 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BORCS6Q96GS4 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BORCS6Q96GS4 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BORCS6Q96GS4 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
BORCS6Q96GS4 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BORCS6Q96GS4 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BORCS6Q96GS4 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BORCS6Q96GS4 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BORCS6Q96GS4 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BORCS6Q96GS4 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BORCS6Q96GS4 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BORCS6Q96GS4 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BORCS6Q96GS4 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BORCS6Q96GS4 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BORCS6Q96GS4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms