Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH3

MALSU1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALSU1Q96EH3 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MALSU1Q96EH3 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MALSU1Q96EH3 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MALSU1Q96EH3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MALSU1Q96EH3 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MALSU1Q96EH3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MALSU1Q96EH3 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MALSU1Q96EH3 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MALSU1Q96EH3 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MALSU1Q96EH3 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MALSU1Q96EH3 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MALSU1Q96EH3 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MALSU1Q96EH3 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MALSU1Q96EH3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MALSU1Q96EH3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MALSU1Q96EH3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MALSU1Q96EH3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MALSU1Q96EH3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MALSU1Q96EH3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MALSU1Q96EH3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MALSU1Q96EH3 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MALSU1Q96EH3 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MALSU1Q96EH3 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MALSU1Q96EH3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MALSU1Q96EH3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
MALSU1Q96EH3 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MALSU1Q96EH3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MALSU1Q96EH3 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms