Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM1

PGBD4, PiggyBac transposable element-derived protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD4Q96DM1 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGBD4Q96DM1 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGBD4Q96DM1 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGBD4Q96DM1 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGBD4Q96DM1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGBD4Q96DM1 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGBD4Q96DM1 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGBD4Q96DM1 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGBD4Q96DM1 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGBD4Q96DM1 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGBD4Q96DM1 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGBD4Q96DM1 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGBD4Q96DM1 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PGBD4Q96DM1 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGBD4Q96DM1 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGBD4Q96DM1 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGBD4Q96DM1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PGBD4Q96DM1 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PGBD4Q96DM1 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PGBD4Q96DM1 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PGBD4Q96DM1 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PGBD4Q96DM1 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PGBD4Q96DM1 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PGBD4Q96DM1 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PGBD4Q96DM1 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PGBD4Q96DM1 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PGBD4Q96DM1 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PGBD4Q96DM1 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PGBD4Q96DM1 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PGBD4Q96DM1 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PGBD4Q96DM1 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PGBD4Q96DM1 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PGBD4Q96DM1 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PGBD4Q96DM1 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PGBD4Q96DM1 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGBD4Q96DM1 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGBD4Q96DM1 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGBD4Q96DM1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGBD4Q96DM1 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGBD4Q96DM1 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGBD4Q96DM1 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGBD4Q96DM1 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGBD4Q96DM1 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGBD4Q96DM1 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGBD4Q96DM1 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGBD4Q96DM1 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGBD4Q96DM1 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGBD4Q96DM1 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGBD4Q96DM1 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGBD4Q96DM1 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGBD4Q96DM1 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGBD4Q96DM1 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGBD4Q96DM1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGBD4Q96DM1 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGBD4Q96DM1 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGBD4Q96DM1 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGBD4Q96DM1 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGBD4Q96DM1 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGBD4Q96DM1 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGBD4Q96DM1 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGBD4Q96DM1 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGBD4Q96DM1 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PGBD4Q96DM1 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PGBD4Q96DM1 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PGBD4Q96DM1 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PGBD4Q96DM1 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PGBD4Q96DM1 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PGBD4Q96DM1 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PGBD4Q96DM1 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PGBD4Q96DM1 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PGBD4Q96DM1 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PGBD4Q96DM1 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PGBD4Q96DM1 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PGBD4Q96DM1 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PGBD4Q96DM1 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGBD4Q96DM1 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGBD4Q96DM1 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGBD4Q96DM1 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGBD4Q96DM1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGBD4Q96DM1 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGBD4Q96DM1 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGBD4Q96DM1 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGBD4Q96DM1 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGBD4Q96DM1 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGBD4Q96DM1 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PGBD4Q96DM1 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGBD4Q96DM1 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGBD4Q96DM1 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGBD4Q96DM1 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGBD4Q96DM1 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGBD4Q96DM1 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGBD4Q96DM1 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGBD4Q96DM1 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGBD4Q96DM1 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PGBD4Q96DM1 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PGBD4Q96DM1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PGBD4Q96DM1 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PGBD4Q96DM1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PGBD4Q96DM1 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PGBD4Q96DM1 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms