Protein–RNA interactions for Protein: Q96CJ1

EAF2, ELL-associated factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EAF2Q96CJ1 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EAF2Q96CJ1 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EAF2Q96CJ1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EAF2Q96CJ1 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EAF2Q96CJ1 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EAF2Q96CJ1 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EAF2Q96CJ1 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EAF2Q96CJ1 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EAF2Q96CJ1 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EAF2Q96CJ1 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EAF2Q96CJ1 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EAF2Q96CJ1 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EAF2Q96CJ1 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EAF2Q96CJ1 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EAF2Q96CJ1 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EAF2Q96CJ1 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EAF2Q96CJ1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EAF2Q96CJ1 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EAF2Q96CJ1 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EAF2Q96CJ1 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EAF2Q96CJ1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EAF2Q96CJ1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EAF2Q96CJ1 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EAF2Q96CJ1 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EAF2Q96CJ1 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EAF2Q96CJ1 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EAF2Q96CJ1 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EAF2Q96CJ1 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EAF2Q96CJ1 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EAF2Q96CJ1 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EAF2Q96CJ1 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EAF2Q96CJ1 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EAF2Q96CJ1 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EAF2Q96CJ1 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EAF2Q96CJ1 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EAF2Q96CJ1 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EAF2Q96CJ1 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EAF2Q96CJ1 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EAF2Q96CJ1 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EAF2Q96CJ1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EAF2Q96CJ1 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EAF2Q96CJ1 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EAF2Q96CJ1 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EAF2Q96CJ1 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EAF2Q96CJ1 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EAF2Q96CJ1 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
EAF2Q96CJ1 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EAF2Q96CJ1 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EAF2Q96CJ1 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
EAF2Q96CJ1 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EAF2Q96CJ1 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EAF2Q96CJ1 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EAF2Q96CJ1 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EAF2Q96CJ1 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EAF2Q96CJ1 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
EAF2Q96CJ1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EAF2Q96CJ1 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EAF2Q96CJ1 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EAF2Q96CJ1 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EAF2Q96CJ1 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EAF2Q96CJ1 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EAF2Q96CJ1 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EAF2Q96CJ1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EAF2Q96CJ1 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EAF2Q96CJ1 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EAF2Q96CJ1 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EAF2Q96CJ1 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EAF2Q96CJ1 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EAF2Q96CJ1 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EAF2Q96CJ1 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EAF2Q96CJ1 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EAF2Q96CJ1 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EAF2Q96CJ1 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EAF2Q96CJ1 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EAF2Q96CJ1 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EAF2Q96CJ1 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EAF2Q96CJ1 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
EAF2Q96CJ1 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
EAF2Q96CJ1 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
EAF2Q96CJ1 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
EAF2Q96CJ1 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EAF2Q96CJ1 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EAF2Q96CJ1 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EAF2Q96CJ1 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EAF2Q96CJ1 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EAF2Q96CJ1 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EAF2Q96CJ1 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EAF2Q96CJ1 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EAF2Q96CJ1 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EAF2Q96CJ1 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EAF2Q96CJ1 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EAF2Q96CJ1 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EAF2Q96CJ1 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EAF2Q96CJ1 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EAF2Q96CJ1 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EAF2Q96CJ1 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EAF2Q96CJ1 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EAF2Q96CJ1 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EAF2Q96CJ1 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
EAF2Q96CJ1 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms