Protein–RNA interactions for Protein: Q96CB9

NSUN4, 5-methylcytosine rRNA methyltransferase NSUN4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSUN4Q96CB9 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NSUN4Q96CB9 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NSUN4Q96CB9 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NSUN4Q96CB9 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NSUN4Q96CB9 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NSUN4Q96CB9 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NSUN4Q96CB9 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NSUN4Q96CB9 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NSUN4Q96CB9 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NSUN4Q96CB9 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NSUN4Q96CB9 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NSUN4Q96CB9 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NSUN4Q96CB9 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NSUN4Q96CB9 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NSUN4Q96CB9 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NSUN4Q96CB9 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NSUN4Q96CB9 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NSUN4Q96CB9 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NSUN4Q96CB9 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NSUN4Q96CB9 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NSUN4Q96CB9 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NSUN4Q96CB9 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NSUN4Q96CB9 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NSUN4Q96CB9 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NSUN4Q96CB9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NSUN4Q96CB9 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NSUN4Q96CB9 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NSUN4Q96CB9 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NSUN4Q96CB9 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NSUN4Q96CB9 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NSUN4Q96CB9 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NSUN4Q96CB9 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NSUN4Q96CB9 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NSUN4Q96CB9 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NSUN4Q96CB9 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NSUN4Q96CB9 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NSUN4Q96CB9 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NSUN4Q96CB9 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NSUN4Q96CB9 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NSUN4Q96CB9 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NSUN4Q96CB9 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NSUN4Q96CB9 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NSUN4Q96CB9 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NSUN4Q96CB9 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NSUN4Q96CB9 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NSUN4Q96CB9 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NSUN4Q96CB9 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NSUN4Q96CB9 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NSUN4Q96CB9 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NSUN4Q96CB9 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NSUN4Q96CB9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NSUN4Q96CB9 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NSUN4Q96CB9 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NSUN4Q96CB9 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NSUN4Q96CB9 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NSUN4Q96CB9 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NSUN4Q96CB9 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NSUN4Q96CB9 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NSUN4Q96CB9 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NSUN4Q96CB9 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NSUN4Q96CB9 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NSUN4Q96CB9 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NSUN4Q96CB9 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NSUN4Q96CB9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NSUN4Q96CB9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NSUN4Q96CB9 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NSUN4Q96CB9 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NSUN4Q96CB9 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NSUN4Q96CB9 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NSUN4Q96CB9 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NSUN4Q96CB9 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NSUN4Q96CB9 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NSUN4Q96CB9 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NSUN4Q96CB9 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NSUN4Q96CB9 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NSUN4Q96CB9 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NSUN4Q96CB9 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NSUN4Q96CB9 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NSUN4Q96CB9 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NSUN4Q96CB9 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NSUN4Q96CB9 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NSUN4Q96CB9 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NSUN4Q96CB9 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NSUN4Q96CB9 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NSUN4Q96CB9 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NSUN4Q96CB9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NSUN4Q96CB9 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NSUN4Q96CB9 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NSUN4Q96CB9 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NSUN4Q96CB9 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NSUN4Q96CB9 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NSUN4Q96CB9 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NSUN4Q96CB9 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NSUN4Q96CB9 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NSUN4Q96CB9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NSUN4Q96CB9 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NSUN4Q96CB9 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NSUN4Q96CB9 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NSUN4Q96CB9 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NSUN4Q96CB9 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
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