Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms