Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

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Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM63Q969Q1 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM63Q969Q1 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM63Q969Q1 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM63Q969Q1 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM63Q969Q1 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM63Q969Q1 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM63Q969Q1 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM63Q969Q1 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM63Q969Q1 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM63Q969Q1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM63Q969Q1 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM63Q969Q1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM63Q969Q1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM63Q969Q1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM63Q969Q1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM63Q969Q1 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM63Q969Q1 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM63Q969Q1 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM63Q969Q1 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM63Q969Q1 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM63Q969Q1 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM63Q969Q1 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM63Q969Q1 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM63Q969Q1 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM63Q969Q1 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM63Q969Q1 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM63Q969Q1 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM63Q969Q1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM63Q969Q1 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM63Q969Q1 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM63Q969Q1 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM63Q969Q1 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM63Q969Q1 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM63Q969Q1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM63Q969Q1 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM63Q969Q1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM63Q969Q1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM63Q969Q1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM63Q969Q1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM63Q969Q1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM63Q969Q1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM63Q969Q1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM63Q969Q1 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM63Q969Q1 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM63Q969Q1 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM63Q969Q1 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM63Q969Q1 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM63Q969Q1 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM63Q969Q1 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM63Q969Q1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM63Q969Q1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM63Q969Q1 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM63Q969Q1 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM63Q969Q1 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM63Q969Q1 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM63Q969Q1 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM63Q969Q1 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM63Q969Q1 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM63Q969Q1 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM63Q969Q1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM63Q969Q1 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM63Q969Q1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM63Q969Q1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM63Q969Q1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM63Q969Q1 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM63Q969Q1 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM63Q969Q1 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM63Q969Q1 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM63Q969Q1 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM63Q969Q1 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM63Q969Q1 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM63Q969Q1 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM63Q969Q1 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
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TRIM63Q969Q1 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM63Q969Q1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM63Q969Q1 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM63Q969Q1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM63Q969Q1 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM63Q969Q1 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM63Q969Q1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM63Q969Q1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM63Q969Q1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM63Q969Q1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM63Q969Q1 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM63Q969Q1 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM63Q969Q1 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM63Q969Q1 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM63Q969Q1 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM63Q969Q1 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM63Q969Q1 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM63Q969Q1 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM63Q969Q1 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM63Q969Q1 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM63Q969Q1 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM63Q969Q1 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM63Q969Q1 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM63Q969Q1 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM63Q969Q1 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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