Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
HLA-CQ95604 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HLA-CQ95604 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HLA-CQ95604 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HLA-CQ95604 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HLA-CQ95604 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HLA-CQ95604 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HLA-CQ95604 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HLA-CQ95604 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HLA-CQ95604 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HLA-CQ95604 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HLA-CQ95604 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HLA-CQ95604 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HLA-CQ95604 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HLA-CQ95604 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HLA-CQ95604 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HLA-CQ95604 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HLA-CQ95604 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HLA-CQ95604 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HLA-CQ95604 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HLA-CQ95604 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HLA-CQ95604 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HLA-CQ95604 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HLA-CQ95604 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HLA-CQ95604 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HLA-CQ95604 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HLA-CQ95604 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HLA-CQ95604 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
HLA-CQ95604 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HLA-CQ95604 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HLA-CQ95604 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HLA-CQ95604 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HLA-CQ95604 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
HLA-CQ95604 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HLA-CQ95604 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HLA-CQ95604 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
HLA-CQ95604 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HLA-CQ95604 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
HLA-CQ95604 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HLA-CQ95604 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HLA-CQ95604 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
HLA-CQ95604 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HLA-CQ95604 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
HLA-CQ95604 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HLA-CQ95604 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HLA-CQ95604 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HLA-CQ95604 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HLA-CQ95604 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HLA-CQ95604 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HLA-CQ95604 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HLA-CQ95604 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HLA-CQ95604 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HLA-CQ95604 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HLA-CQ95604 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HLA-CQ95604 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HLA-CQ95604 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HLA-CQ95604 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HLA-CQ95604 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HLA-CQ95604 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HLA-CQ95604 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HLA-CQ95604 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
HLA-CQ95604 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HLA-CQ95604 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HLA-CQ95604 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HLA-CQ95604 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HLA-CQ95604 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HLA-CQ95604 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HLA-CQ95604 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
HLA-CQ95604 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HLA-CQ95604 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
HLA-CQ95604 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HLA-CQ95604 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HLA-CQ95604 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HLA-CQ95604 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HLA-CQ95604 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HLA-CQ95604 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
HLA-CQ95604 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HLA-CQ95604 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HLA-CQ95604 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HLA-CQ95604 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HLA-CQ95604 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HLA-CQ95604 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HLA-CQ95604 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HLA-CQ95604 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HLA-CQ95604 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HLA-CQ95604 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HLA-CQ95604 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HLA-CQ95604 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HLA-CQ95604 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HLA-CQ95604 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HLA-CQ95604 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HLA-CQ95604 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HLA-CQ95604 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HLA-CQ95604 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HLA-CQ95604 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HLA-CQ95604 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
HLA-CQ95604 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HLA-CQ95604 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HLA-CQ95604 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HLA-CQ95604 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms