Protein–RNA interactions for Protein: Q92878

RAD50, DNA repair protein RAD50, humanhuman

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD50Q92878 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAD50Q92878 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAD50Q92878 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAD50Q92878 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAD50Q92878 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAD50Q92878 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAD50Q92878 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RAD50Q92878 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAD50Q92878 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAD50Q92878 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAD50Q92878 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAD50Q92878 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAD50Q92878 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAD50Q92878 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAD50Q92878 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAD50Q92878 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAD50Q92878 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAD50Q92878 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAD50Q92878 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RAD50Q92878 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAD50Q92878 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAD50Q92878 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAD50Q92878 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAD50Q92878 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAD50Q92878 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAD50Q92878 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RAD50Q92878 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAD50Q92878 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAD50Q92878 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RAD50Q92878 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RAD50Q92878 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAD50Q92878 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAD50Q92878 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAD50Q92878 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAD50Q92878 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAD50Q92878 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAD50Q92878 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAD50Q92878 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAD50Q92878 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAD50Q92878 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAD50Q92878 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAD50Q92878 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAD50Q92878 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAD50Q92878 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAD50Q92878 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAD50Q92878 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAD50Q92878 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAD50Q92878 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAD50Q92878 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAD50Q92878 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAD50Q92878 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAD50Q92878 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAD50Q92878 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAD50Q92878 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAD50Q92878 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAD50Q92878 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAD50Q92878 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAD50Q92878 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAD50Q92878 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAD50Q92878 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAD50Q92878 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RAD50Q92878 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAD50Q92878 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAD50Q92878 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RAD50Q92878 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RAD50Q92878 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAD50Q92878 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAD50Q92878 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAD50Q92878 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAD50Q92878 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAD50Q92878 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAD50Q92878 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAD50Q92878 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RAD50Q92878 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAD50Q92878 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAD50Q92878 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAD50Q92878 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAD50Q92878 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAD50Q92878 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RAD50Q92878 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAD50Q92878 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RAD50Q92878 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RAD50Q92878 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RAD50Q92878 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAD50Q92878 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAD50Q92878 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAD50Q92878 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAD50Q92878 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAD50Q92878 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RAD50Q92878 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAD50Q92878 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAD50Q92878 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAD50Q92878 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAD50Q92878 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAD50Q92878 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAD50Q92878 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAD50Q92878 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAD50Q92878 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAD50Q92878 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAD50Q92878 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms