Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXU2

DNAAF4, Dynein assembly factor 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF4Q8WXU2 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DNAAF4Q8WXU2 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DNAAF4Q8WXU2 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
DNAAF4Q8WXU2 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DNAAF4Q8WXU2 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DNAAF4Q8WXU2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DNAAF4Q8WXU2 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DNAAF4Q8WXU2 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DNAAF4Q8WXU2 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DNAAF4Q8WXU2 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
DNAAF4Q8WXU2 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
DNAAF4Q8WXU2 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
DNAAF4Q8WXU2 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DNAAF4Q8WXU2 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DNAAF4Q8WXU2 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
DNAAF4Q8WXU2 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
DNAAF4Q8WXU2 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
DNAAF4Q8WXU2 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
DNAAF4Q8WXU2 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
DNAAF4Q8WXU2 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
DNAAF4Q8WXU2 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DNAAF4Q8WXU2 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
DNAAF4Q8WXU2 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
DNAAF4Q8WXU2 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
DNAAF4Q8WXU2 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
DNAAF4Q8WXU2 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
DNAAF4Q8WXU2 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
DNAAF4Q8WXU2 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
DNAAF4Q8WXU2 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
DNAAF4Q8WXU2 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
DNAAF4Q8WXU2 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
DNAAF4Q8WXU2 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
DNAAF4Q8WXU2 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DNAAF4Q8WXU2 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DNAAF4Q8WXU2 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DNAAF4Q8WXU2 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DNAAF4Q8WXU2 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DNAAF4Q8WXU2 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DNAAF4Q8WXU2 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DNAAF4Q8WXU2 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DNAAF4Q8WXU2 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DNAAF4Q8WXU2 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DNAAF4Q8WXU2 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DNAAF4Q8WXU2 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DNAAF4Q8WXU2 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DNAAF4Q8WXU2 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DNAAF4Q8WXU2 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DNAAF4Q8WXU2 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DNAAF4Q8WXU2 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DNAAF4Q8WXU2 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DNAAF4Q8WXU2 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DNAAF4Q8WXU2 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DNAAF4Q8WXU2 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
DNAAF4Q8WXU2 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DNAAF4Q8WXU2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DNAAF4Q8WXU2 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DNAAF4Q8WXU2 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DNAAF4Q8WXU2 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DNAAF4Q8WXU2 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DNAAF4Q8WXU2 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DNAAF4Q8WXU2 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DNAAF4Q8WXU2 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DNAAF4Q8WXU2 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DNAAF4Q8WXU2 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DNAAF4Q8WXU2 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DNAAF4Q8WXU2 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DNAAF4Q8WXU2 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DNAAF4Q8WXU2 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
DNAAF4Q8WXU2 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
DNAAF4Q8WXU2 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DNAAF4Q8WXU2 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DNAAF4Q8WXU2 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DNAAF4Q8WXU2 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DNAAF4Q8WXU2 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DNAAF4Q8WXU2 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DNAAF4Q8WXU2 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DNAAF4Q8WXU2 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DNAAF4Q8WXU2 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DNAAF4Q8WXU2 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DNAAF4Q8WXU2 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DNAAF4Q8WXU2 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DNAAF4Q8WXU2 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DNAAF4Q8WXU2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DNAAF4Q8WXU2 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DNAAF4Q8WXU2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DNAAF4Q8WXU2 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DNAAF4Q8WXU2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DNAAF4Q8WXU2 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DNAAF4Q8WXU2 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DNAAF4Q8WXU2 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DNAAF4Q8WXU2 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DNAAF4Q8WXU2 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DNAAF4Q8WXU2 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DNAAF4Q8WXU2 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DNAAF4Q8WXU2 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DNAAF4Q8WXU2 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DNAAF4Q8WXU2 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
DNAAF4Q8WXU2 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DNAAF4Q8WXU2 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DNAAF4Q8WXU2 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms