Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF1

PSPC1, Paraspeckle component 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPC1Q8WXF1 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSPC1Q8WXF1 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSPC1Q8WXF1 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSPC1Q8WXF1 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSPC1Q8WXF1 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSPC1Q8WXF1 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSPC1Q8WXF1 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSPC1Q8WXF1 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PSPC1Q8WXF1 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSPC1Q8WXF1 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSPC1Q8WXF1 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PSPC1Q8WXF1 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSPC1Q8WXF1 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSPC1Q8WXF1 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSPC1Q8WXF1 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSPC1Q8WXF1 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PSPC1Q8WXF1 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSPC1Q8WXF1 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSPC1Q8WXF1 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSPC1Q8WXF1 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSPC1Q8WXF1 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSPC1Q8WXF1 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PSPC1Q8WXF1 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PSPC1Q8WXF1 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSPC1Q8WXF1 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSPC1Q8WXF1 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSPC1Q8WXF1 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSPC1Q8WXF1 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSPC1Q8WXF1 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSPC1Q8WXF1 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSPC1Q8WXF1 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSPC1Q8WXF1 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSPC1Q8WXF1 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSPC1Q8WXF1 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSPC1Q8WXF1 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSPC1Q8WXF1 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSPC1Q8WXF1 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSPC1Q8WXF1 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSPC1Q8WXF1 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSPC1Q8WXF1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSPC1Q8WXF1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSPC1Q8WXF1 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSPC1Q8WXF1 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSPC1Q8WXF1 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSPC1Q8WXF1 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSPC1Q8WXF1 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSPC1Q8WXF1 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PSPC1Q8WXF1 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSPC1Q8WXF1 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSPC1Q8WXF1 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSPC1Q8WXF1 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSPC1Q8WXF1 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSPC1Q8WXF1 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSPC1Q8WXF1 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSPC1Q8WXF1 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSPC1Q8WXF1 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSPC1Q8WXF1 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSPC1Q8WXF1 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSPC1Q8WXF1 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSPC1Q8WXF1 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSPC1Q8WXF1 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSPC1Q8WXF1 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSPC1Q8WXF1 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSPC1Q8WXF1 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSPC1Q8WXF1 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSPC1Q8WXF1 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSPC1Q8WXF1 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSPC1Q8WXF1 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSPC1Q8WXF1 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSPC1Q8WXF1 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSPC1Q8WXF1 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSPC1Q8WXF1 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSPC1Q8WXF1 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSPC1Q8WXF1 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSPC1Q8WXF1 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSPC1Q8WXF1 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSPC1Q8WXF1 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSPC1Q8WXF1 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSPC1Q8WXF1 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSPC1Q8WXF1 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSPC1Q8WXF1 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSPC1Q8WXF1 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSPC1Q8WXF1 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSPC1Q8WXF1 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSPC1Q8WXF1 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSPC1Q8WXF1 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSPC1Q8WXF1 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSPC1Q8WXF1 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSPC1Q8WXF1 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSPC1Q8WXF1 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSPC1Q8WXF1 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSPC1Q8WXF1 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSPC1Q8WXF1 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSPC1Q8WXF1 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSPC1Q8WXF1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSPC1Q8WXF1 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSPC1Q8WXF1 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSPC1Q8WXF1 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PSPC1Q8WXF1 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSPC1Q8WXF1 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
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