Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWI1

LMO7, LIM domain only protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO7Q8WWI1 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LMO7Q8WWI1 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LMO7Q8WWI1 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LMO7Q8WWI1 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LMO7Q8WWI1 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
LMO7Q8WWI1 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LMO7Q8WWI1 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LMO7Q8WWI1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LMO7Q8WWI1 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LMO7Q8WWI1 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
LMO7Q8WWI1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LMO7Q8WWI1 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LMO7Q8WWI1 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LMO7Q8WWI1 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LMO7Q8WWI1 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LMO7Q8WWI1 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LMO7Q8WWI1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LMO7Q8WWI1 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LMO7Q8WWI1 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LMO7Q8WWI1 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LMO7Q8WWI1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
LMO7Q8WWI1 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LMO7Q8WWI1 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LMO7Q8WWI1 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LMO7Q8WWI1 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LMO7Q8WWI1 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LMO7Q8WWI1 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
LMO7Q8WWI1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LMO7Q8WWI1 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LMO7Q8WWI1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LMO7Q8WWI1 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LMO7Q8WWI1 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LMO7Q8WWI1 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
LMO7Q8WWI1 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LMO7Q8WWI1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LMO7Q8WWI1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LMO7Q8WWI1 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LMO7Q8WWI1 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LMO7Q8WWI1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LMO7Q8WWI1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LMO7Q8WWI1 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LMO7Q8WWI1 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LMO7Q8WWI1 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LMO7Q8WWI1 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LMO7Q8WWI1 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LMO7Q8WWI1 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LMO7Q8WWI1 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
LMO7Q8WWI1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LMO7Q8WWI1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LMO7Q8WWI1 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LMO7Q8WWI1 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LMO7Q8WWI1 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LMO7Q8WWI1 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LMO7Q8WWI1 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LMO7Q8WWI1 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LMO7Q8WWI1 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LMO7Q8WWI1 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LMO7Q8WWI1 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LMO7Q8WWI1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LMO7Q8WWI1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LMO7Q8WWI1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LMO7Q8WWI1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LMO7Q8WWI1 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LMO7Q8WWI1 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LMO7Q8WWI1 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LMO7Q8WWI1 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LMO7Q8WWI1 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LMO7Q8WWI1 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
LMO7Q8WWI1 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LMO7Q8WWI1 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LMO7Q8WWI1 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
LMO7Q8WWI1 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LMO7Q8WWI1 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LMO7Q8WWI1 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LMO7Q8WWI1 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LMO7Q8WWI1 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LMO7Q8WWI1 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LMO7Q8WWI1 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LMO7Q8WWI1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LMO7Q8WWI1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LMO7Q8WWI1 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LMO7Q8WWI1 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
LMO7Q8WWI1 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LMO7Q8WWI1 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
LMO7Q8WWI1 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LMO7Q8WWI1 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LMO7Q8WWI1 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LMO7Q8WWI1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LMO7Q8WWI1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LMO7Q8WWI1 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LMO7Q8WWI1 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LMO7Q8WWI1 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LMO7Q8WWI1 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LMO7Q8WWI1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LMO7Q8WWI1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LMO7Q8WWI1 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LMO7Q8WWI1 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LMO7Q8WWI1 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
LMO7Q8WWI1 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LMO7Q8WWI1 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms